More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0817 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  52.15 
 
 		 708 aa  681    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  80.06 
 
 		 705 aa  1159    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  95.3 
 
 		 702 aa  1370    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 702 aa  1425    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  43.06 
 
 		 698 aa  544  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 		 743 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 		 743 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  33.85 
 
 		 751 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 743 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 743 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  33.81 
 
 		 743 aa  302  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 		 743 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 719 aa  281  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 		 729 aa  268  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 710 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 706 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 		 710 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  30.37 
 
 		 712 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 		 707 aa  244  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 		 707 aa  244  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 		 707 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 		 738 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.11 
 
 		 724 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 		 724 aa  241  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  29.99 
 
 		 771 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 728 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 729 aa  233  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 715 aa  226  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 		 727 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 727 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 805 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  28.22 
 
 		 744 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  28.73 
 
 		 804 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 802 aa  218  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 819 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  28.59 
 
 		 804 aa  217  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 722 aa  217  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 725 aa  214  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 685 aa  212  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 726 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 729 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 746 aa  210  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  29.86 
 
 		 722 aa  210  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2394  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 		 729 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 772 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 772 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 823 aa  208  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 726 aa  208  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 809 aa  207  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 773 aa  203  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 811 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.53 
 
 		 704 aa  200  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  26.66 
 
 		 811 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 729 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 761 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 808 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 710 aa  197  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 716 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  29.12 
 
 		 737 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  29.07 
 
 		 731 aa  196  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 708 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 800 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 728 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 729 aa  195  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 730 aa  194  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 753 aa  194  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 801 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  26.3 
 
 		 730 aa  194  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 777 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 758 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 768 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 742 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 801 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 753 aa  191  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 804 aa  190  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 707 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 754 aa  189  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  28.17 
 
 		 697 aa  187  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 737 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  27.79 
 
 		 746 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 750 aa  186  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 728 aa  185  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 718 aa  182  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 742 aa  181  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 724 aa  181  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 839 aa  180  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 851 aa  180  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 768 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 712 aa  180  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 714 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  26.29 
 
 		 763 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 706 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 710 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 773 aa  178  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 761 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 762 aa  177  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  26.34 
 
 		 720 aa  177  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 727 aa  177  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 755 aa  177  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 770 aa  177  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>