More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5213 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  55.34 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  54.37 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  45.92 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  42.78 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 243 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 244 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  44.1 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 251 aa  148  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  43.46 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  41.24 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  41.24 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  40.72 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 		 230 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  41.24 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 223 aa  141  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  43.09 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  42.05 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  39.2 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 		 216 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 238 aa  131  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 220 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 226 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  43.81 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  39.06 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  38.95 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  39.59 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  40.33 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  39.15 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  39.15 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  39.88 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33.89 
 
 		 229 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 235 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.89 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.03 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  34.32 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 224 aa  101  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 284 aa  101  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 255 aa  101  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  32.42 
 
 		 274 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 235 aa  99  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  29.17 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 228 aa  98.6  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 239 aa  98.6  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 		 256 aa  98.6  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  31.87 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>