74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3832 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  95.75 
 
 		 474 aa  866    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 471 aa  922    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  62.47 
 
 		 467 aa  531  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  59.57 
 
 		 474 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  48.25 
 
 		 490 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  41.54 
 
 		 468 aa  356  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  36.55 
 
 		 456 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  37.75 
 
 		 455 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  36.36 
 
 		 460 aa  261  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  36.3 
 
 		 456 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  36.99 
 
 		 458 aa  259  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  36.83 
 
 		 458 aa  253  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  35.86 
 
 		 453 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  35.46 
 
 		 459 aa  240  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  35.28 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  37.5 
 
 		 446 aa  200  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  35.02 
 
 		 458 aa  192  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  35.19 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  36.61 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  36.48 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 		 539 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  26.08 
 
 		 461 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 453 aa  87.4  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 446 aa  87  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 		 499 aa  87  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  31.6 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  33.98 
 
 		 495 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  27 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  30.32 
 
 		 494 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  30.57 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  30.34 
 
 		 496 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  29.47 
 
 		 504 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  22.22 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  20.34 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  28.33 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  26.32 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  21.99 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.07 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 482 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  26.03 
 
 		 490 aa  54.3  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 		 512 aa  53.9  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 		 504 aa  53.5  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4321  polysaccharide biosynthesis protein  26.81 
 
 		 456 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 505 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 		 475 aa  51.2  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 495 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  34.26 
 
 		 529 aa  50.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1836  hypothetical protein  33.63 
 
 		 523 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  29.9 
 
 		 536 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1827  hypothetical protein  32.5 
 
 		 522 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.356009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  29.44 
 
 		 504 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  33.96 
 
 		 135 aa  47.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5069  Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  23.49 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  32.22 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4028  polysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  31.37 
 
 		 486 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  29.95 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0639  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 		 458 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216711  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1074  polysaccharide biosynthesis protein  27.87 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0510405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  29.73 
 
 		 480 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  23.02 
 
 		 449 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 434 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  27.01 
 
 		 488 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 484 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 463 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>