More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1885 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
125 aa  239  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  96 
 
 
125 aa  230  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  59.68 
 
 
125 aa  144  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  64.17 
 
 
128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  52.5 
 
 
134 aa  118  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  52.85 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  52.85 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  50.81 
 
 
125 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  47.5 
 
 
126 aa  106  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 
124 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  47.46 
 
 
126 aa  97.1  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  46.28 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  46.77 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  41.23 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  44.72 
 
 
124 aa  93.6  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  41.32 
 
 
126 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  43.64 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  41.32 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  46.73 
 
 
127 aa  92  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  48.18 
 
 
125 aa  90.5  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  47.2 
 
 
125 aa  90.9  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  57.14 
 
 
133 aa  90.1  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  43.55 
 
 
124 aa  90.1  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  44.63 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  52.5 
 
 
124 aa  90.1  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  46.9 
 
 
136 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  47.22 
 
 
130 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  41.13 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  36.8 
 
 
130 aa  87  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  42.15 
 
 
122 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  44.83 
 
 
133 aa  86.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  47.32 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  44.44 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  43.93 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  41.6 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  43.31 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  47.97 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 
126 aa  84.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  40.8 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  41.13 
 
 
129 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  47.57 
 
 
127 aa  84  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  39.83 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  45.74 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  48.18 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  40.95 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  34.68 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  43.9 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  42.15 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  47.83 
 
 
270 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 
123 aa  80.1  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  41.18 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  43.44 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  40.65 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  43.09 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  38.98 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  47.73 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  43.4 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  47.73 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  42.11 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  43.52 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  45.56 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  45.56 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  43.2 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  40 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  44.86 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  34.68 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  47.37 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  43.64 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  40.68 
 
 
140 aa  77  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  44.35 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  39 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  39 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  43.16 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  45.36 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  37.1 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  42.86 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  34.96 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  43.16 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  45.63 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  41.84 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  38.89 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  33.05 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>