89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0355 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 453 aa  920    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  98.01 
 
 		 453 aa  905    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  74.61 
 
 		 452 aa  689    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  68.21 
 
 		 451 aa  661    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  71.08 
 
 		 452 aa  680    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  66.74 
 
 		 452 aa  624  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  64.32 
 
 		 450 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  63.8 
 
 		 449 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  63.74 
 
 		 450 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  63.74 
 
 		 450 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  61.81 
 
 		 544 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  58.58 
 
 		 452 aa  536  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  59.86 
 
 		 449 aa  525  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  41.97 
 
 		 485 aa  322  7e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  40.35 
 
 		 432 aa  307  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  40.35 
 
 		 424 aa  303  6.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  38.33 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  40 
 
 		 451 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  37.97 
 
 		 448 aa  279  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  37.04 
 
 		 447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  37.73 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  37.41 
 
 		 462 aa  263  4e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  35.27 
 
 		 448 aa  256  8e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  35.25 
 
 		 482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  34 
 
 		 448 aa  249  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  34.79 
 
 		 457 aa  246  6e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  32.98 
 
 		 464 aa  245  9e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  35.99 
 
 		 498 aa  243  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.25 
 
 		 448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  35.59 
 
 		 440 aa  230  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  33.5 
 
 		 444 aa  199  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  32.85 
 
 		 466 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  32.07 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  30.95 
 
 		 455 aa  179  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  30.4 
 
 		 447 aa  176  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  32.23 
 
 		 442 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  31.19 
 
 		 404 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 419 aa  79.7  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  28.25 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  20.51 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.96 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 445 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 495 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  26.92 
 
 		 428 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 493 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  25.23 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 433 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  31.48 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 427 aa  50.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 440 aa  50.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.18 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  22.1 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 412 aa  47.4  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.03 
 
 		 426 aa  46.6  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.75 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.78 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  22.39 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2014  sn-glycerol-3-phosphate-binding periplasmic protein ugpB precursor  23.95 
 
 		 433 aa  44.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.167012  hitchhiker  0.0071297 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  21.36 
 
 		 442 aa  43.9  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 414 aa  43.9  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 429 aa  43.5  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 		 410 aa  43.5  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>