More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3574 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  100 
 
 		 647 aa  1273    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.06 
 
 		 753 aa  619  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.83 
 
 		 732 aa  611  1e-173  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.11 
 
 		 727 aa  586  1e-166  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.5 
 
 		 723 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.7 
 
 		 768 aa  584  1.0000000000000001e-165  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.25 
 
 		 709 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.23 
 
 		 718 aa  580  1e-164  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.15 
 
 		 719 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.77 
 
 		 721 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.08 
 
 		 808 aa  569  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.36 
 
 		 715 aa  571  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  51.08 
 
 		 722 aa  570  1e-161  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.14 
 
 		 701 aa  570  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  53.36 
 
 		 732 aa  570  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.6 
 
 		 769 aa  567  1e-160  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.13 
 
 		 731 aa  567  1e-160  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.85 
 
 		 731 aa  567  1e-160  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  50.43 
 
 		 810 aa  566  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.13 
 
 		 731 aa  566  1e-160  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.3 
 
 		 731 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.58 
 
 		 735 aa  559  1e-158  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  48.92 
 
 		 754 aa  560  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  50.62 
 
 		 718 aa  561  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.5 
 
 		 730 aa  558  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.33 
 
 		 806 aa  557  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.32 
 
 		 760 aa  555  1e-156  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.99 
 
 		 759 aa  555  1e-156  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.08 
 
 		 754 aa  553  1e-156  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.45 
 
 		 742 aa  550  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.12 
 
 		 738 aa  551  1e-155  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.88 
 
 		 736 aa  551  1e-155  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  55.27 
 
 		 739 aa  550  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.82 
 
 		 757 aa  546  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  50.09 
 
 		 763 aa  546  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50 
 
 		 740 aa  546  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  48.81 
 
 		 713 aa  546  1e-154  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.28 
 
 		 756 aa  548  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.09 
 
 		 740 aa  544  1e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.63 
 
 		 743 aa  542  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  49.17 
 
 		 764 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 		 736 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.47 
 
 		 737 aa  541  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50 
 
 		 742 aa  539  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.36 
 
 		 738 aa  541  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.03 
 
 		 738 aa  538  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.32 
 
 		 754 aa  536  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.38 
 
 		 754 aa  534  1e-150  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.99 
 
 		 781 aa  531  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.51 
 
 		 737 aa  531  1e-149  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  48.49 
 
 		 810 aa  530  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.64 
 
 		 801 aa  530  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.53 
 
 		 763 aa  529  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  50.7 
 
 		 804 aa  525  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  48.31 
 
 		 829 aa  527  1e-148  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 		 757 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.82 
 
 		 754 aa  521  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.83 
 
 		 757 aa  521  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  48.23 
 
 		 775 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.43 
 
 		 704 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.37 
 
 		 755 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50 
 
 		 852 aa  514  1e-144  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  47.16 
 
 		 814 aa  511  1e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.04 
 
 		 773 aa  509  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  53.92 
 
 		 746 aa  505  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  51.53 
 
 		 739 aa  503  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.91 
 
 		 805 aa  504  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.33 
 
 		 772 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.09 
 
 		 801 aa  504  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  45.2 
 
 		 721 aa  502  1e-141  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  46.43 
 
 		 806 aa  501  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.29 
 
 		 804 aa  498  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.2 
 
 		 805 aa  490  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.68 
 
 		 784 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.88 
 
 		 781 aa  478  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  46.09 
 
 		 703 aa  478  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  48.13 
 
 		 699 aa  478  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.18 
 
 		 810 aa  478  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  44.54 
 
 		 826 aa  478  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  51.3 
 
 		 776 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  48.37 
 
 		 613 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  42.81 
 
 		 703 aa  468  9.999999999999999e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.38 
 
 		 800 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  42.7 
 
 		 639 aa  464  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  47.77 
 
 		 601 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  47.02 
 
 		 930 aa  457  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  43.04 
 
 		 685 aa  439  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  44.47 
 
 		 788 aa  421  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  41.49 
 
 		 803 aa  417  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  43.94 
 
 		 567 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  42.56 
 
 		 550 aa  391  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  40.61 
 
 		 691 aa  382  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  42.13 
 
 		 729 aa  379  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  37.86 
 
 		 832 aa  360  4e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.190339 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  40 
 
 		 607 aa  348  1e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  38.64 
 
 		 599 aa  331  3e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40257  predicted protein  41.92 
 
 		 537 aa  318  3e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  38.52 
 
 		 749 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  39.69 
 
 		 748 aa  298  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23826  predicted protein  35.39 
 
 		 552 aa  296  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>