More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0720 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 326 aa  679    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  54.6 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  52.73 
 
 		 327 aa  345  8e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 285 aa  341  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 343 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 341 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  48.11 
 
 		 344 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  47.83 
 
 		 331 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 330 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 338 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  41.32 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  38.54 
 
 		 314 aa  235  7e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  37.03 
 
 		 320 aa  221  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  39.04 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  41.99 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  36.82 
 
 		 336 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 340 aa  182  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  32.62 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2398  cyclic nucleotide-binding protein  34.06 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00401511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 321 aa  177  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 326 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.59 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  37.77 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  36.65 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  37.39 
 
 		 347 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 323 aa  165  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 335 aa  165  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.92 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  29.5 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  32.9 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 320 aa  162  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.47 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  36.21 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 337 aa  159  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  34.33 
 
 		 326 aa  159  8e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  35.86 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  35.04 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  34.93 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  30.33 
 
 		 351 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 349 aa  155  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.71 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  32.6 
 
 		 334 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  34.51 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.52 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  31.2 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  29.87 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  34.47 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  32.75 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.91 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  33.33 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  36.22 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  34.05 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  31.83 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  32.23 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  29.38 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.55 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.5 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  33.2 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  34.06 
 
 		 338 aa  142  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  35.32 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  32.17 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  32.17 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  32.17 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>