More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0407 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0407  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 315 aa  638    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.323817  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  47.21 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  41.64 
 
 		 336 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  42.35 
 
 		 331 aa  212  7.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  37.78 
 
 		 296 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  38.37 
 
 		 287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  35.62 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0108  MscS mechanosensitive ion channel  38.46 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  37.98 
 
 		 324 aa  172  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  35.8 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  31.21 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  34.06 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 445 aa  135  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  27.16 
 
 		 311 aa  135  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  31.01 
 
 		 276 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  32.27 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  31.5 
 
 		 295 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  35.62 
 
 		 356 aa  126  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  28.09 
 
 		 429 aa  125  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  28.78 
 
 		 563 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  34.95 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  29.43 
 
 		 538 aa  122  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  27.44 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  27.37 
 
 		 532 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  32.01 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  33.09 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  28.23 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  34.43 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  29.36 
 
 		 414 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  27.95 
 
 		 270 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  29.55 
 
 		 534 aa  119  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 547 aa  119  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  29.3 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5986  MscS Mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 305 aa  119  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  31.97 
 
 		 268 aa  119  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  32.49 
 
 		 310 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  30.64 
 
 		 400 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  33.71 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  30.56 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  28.78 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  31.5 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 549 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  29.03 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 549 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 550 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  30.12 
 
 		 279 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 549 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  27.61 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  32.89 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  32.89 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  32.73 
 
 		 272 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  28.36 
 
 		 533 aa  116  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1966  hypothetical protein  29.44 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  32.89 
 
 		 275 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  34.29 
 
 		 360 aa  116  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  31.36 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  27.37 
 
 		 551 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 551 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  26.69 
 
 		 561 aa  115  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  31.58 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  28.41 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 862 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.61 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1226  MscS mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.735162  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 279 aa  114  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  33.81 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  29.18 
 
 		 547 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 289 aa  113  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1229  MscS mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337735  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  30.61 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  32.93 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  30.5 
 
 		 450 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  28.3 
 
 		 544 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  32.39 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  27.68 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  34.41 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  31.33 
 
 		 449 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>