65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3798 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  100 
 
 		 470 aa  969    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  55.9 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  56.75 
 
 		 457 aa  498  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  56.29 
 
 		 457 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  37.07 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  24.7 
 
 		 644 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  24.82 
 
 		 659 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  23.99 
 
 		 668 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  25.25 
 
 		 708 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  26.09 
 
 		 621 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  23.98 
 
 		 743 aa  92  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  23.4 
 
 		 708 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  23.48 
 
 		 704 aa  87  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  22.95 
 
 		 703 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  23.5 
 
 		 730 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  24.3 
 
 		 707 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  23.06 
 
 		 704 aa  84.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  23.68 
 
 		 701 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  22.65 
 
 		 729 aa  83.6  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  23.32 
 
 		 719 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  22.47 
 
 		 727 aa  83.2  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  22.65 
 
 		 728 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  22.39 
 
 		 733 aa  82.8  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  23.53 
 
 		 719 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  22.14 
 
 		 730 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  22.57 
 
 		 706 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  23.16 
 
 		 730 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  22.14 
 
 		 730 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  23.29 
 
 		 719 aa  80.9  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  23.21 
 
 		 718 aa  80.5  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  22.6 
 
 		 719 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  24.03 
 
 		 664 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  22.59 
 
 		 718 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  22.59 
 
 		 718 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  21.8 
 
 		 635 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  22.45 
 
 		 721 aa  77  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  22.43 
 
 		 615 aa  76.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  31.93 
 
 		 752 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  21.3 
 
 		 635 aa  73.2  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  22.34 
 
 		 633 aa  71.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  25.06 
 
 		 637 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  22.71 
 
 		 629 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  21.45 
 
 		 744 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  21.68 
 
 		 743 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  22.67 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0057  hypothetical protein  21.72 
 
 		 952 aa  55.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.889998  hitchhiker  0.00629192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  22.25 
 
 		 747 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  22.72 
 
 		 765 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1502  TRAG family protein  29.06 
 
 		 610 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.343787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  24.37 
 
 		 792 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  22.45 
 
 		 622 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.12 
 
 		 557 aa  51.6  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  21.47 
 
 		 589 aa  51.2  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1816  IcmO protein  30.26 
 
 		 792 aa  50.8  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0366  IcmO  30.26 
 
 		 792 aa  50.1  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3686  DotL  30 
 
 		 786 aa  48.5  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00900266  normal  0.235831 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0512  hypothetical protein  27.03 
 
 		 783 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0488  hypothetical protein  27.03 
 
 		 783 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  40 
 
 		 876 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  21.41 
 
 		 622 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  22.57 
 
 		 751 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  44 
 
 		 833 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3620  TRAG family protein  26.32 
 
 		 896 aa  44.3  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1251  lipoprotein, putative  22.38 
 
 		 619 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  25 
 
 		 629 aa  43.9  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>