More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2476 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  100 
 
 		 214 aa  441  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  54.34 
 
 		 188 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  49.24 
 
 		 207 aa  198  6e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  54.02 
 
 		 207 aa  187  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  58.87 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  45.9 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  46.28 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  47.5 
 
 		 159 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 193 aa  122  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  42.86 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  42.86 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  42.86 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  42.86 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  42.86 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  42.86 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  42.86 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  50.43 
 
 		 150 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  41.03 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  45 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  45 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  40.88 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  40.88 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  45 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  39.44 
 
 		 216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  43.57 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  50 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  50 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  50 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  44.74 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  37.91 
 
 		 173 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  48.65 
 
 		 333 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 369 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  38.12 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  39.87 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  41.46 
 
 		 404 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  47.46 
 
 		 154 aa  108  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  47.46 
 
 		 154 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  41.8 
 
 		 407 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  40.98 
 
 		 407 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  47.46 
 
 		 154 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  41.8 
 
 		 407 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  47.46 
 
 		 154 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  41.8 
 
 		 407 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  41.8 
 
 		 407 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  41.8 
 
 		 404 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  41.8 
 
 		 407 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  47.86 
 
 		 154 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  40.94 
 
 		 364 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  47.86 
 
 		 154 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  47.86 
 
 		 154 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  47.86 
 
 		 154 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  47.86 
 
 		 154 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  40.88 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2022  NLP/P60 family protein  43.8 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  44.83 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  40.88 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  46.61 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  46.61 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  43.97 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  46.61 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  46.61 
 
 		 154 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  41.22 
 
 		 183 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  46.61 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 179 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  38.69 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  40.16 
 
 		 363 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 363 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  38.97 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  45.61 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 150 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 154 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  43.48 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  45.54 
 
 		 424 aa  104  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 363 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 248 aa  104  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  48.31 
 
 		 384 aa  104  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  41.18 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  39.34 
 
 		 404 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  44.74 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  42.48 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  39.04 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  46.9 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  40.16 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  45.54 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  38.31 
 
 		 174 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  42.34 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  40.16 
 
 		 177 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  45.54 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  42.5 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  39.26 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>