154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1662 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 		 343 aa  711    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  82.8 
 
 		 343 aa  619  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  83.38 
 
 		 343 aa  616  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  81.92 
 
 		 343 aa  610  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  60.06 
 
 		 343 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  57.43 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  52.89 
 
 		 346 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  51.45 
 
 		 341 aa  384  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  53.78 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  51.45 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  53.06 
 
 		 342 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  52.19 
 
 		 343 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  49.86 
 
 		 344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  48.1 
 
 		 343 aa  355  5.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.29 
 
 		 343 aa  354  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  50.72 
 
 		 344 aa  352  5e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  49.85 
 
 		 343 aa  349  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.26 
 
 		 344 aa  346  4e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  50.29 
 
 		 343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  46.94 
 
 		 343 aa  333  2e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  48.38 
 
 		 344 aa  326  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.94 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  48.69 
 
 		 344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  47.51 
 
 		 339 aa  315  5e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  46.78 
 
 		 339 aa  314  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.61 
 
 		 343 aa  298  6e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  43.7 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.31 
 
 		 343 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.57 
 
 		 342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.87 
 
 		 342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  41.69 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  37.69 
 
 		 545 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  36.47 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.96 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  35.42 
 
 		 598 aa  205  8e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.23 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  36.61 
 
 		 594 aa  199  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.55 
 
 		 559 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.53 
 
 		 570 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  36.12 
 
 		 580 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.93 
 
 		 550 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  35.52 
 
 		 325 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  35.22 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.5 
 
 		 544 aa  185  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  32.93 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  32.36 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  34.59 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.76 
 
 		 350 aa  176  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  33.82 
 
 		 525 aa  175  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.22 
 
 		 731 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.63 
 
 		 339 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  33.04 
 
 		 553 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.14 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  29.86 
 
 		 731 aa  169  7e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.38 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  31.49 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.74 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  30.9 
 
 		 727 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  32.44 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.29 
 
 		 347 aa  155  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  28.91 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.36 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.18 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  29.41 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.37 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  31.13 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.18 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.87 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.81 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  30.63 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.57 
 
 		 337 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  28.61 
 
 		 323 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  30.23 
 
 		 337 aa  136  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  29.2 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  30.57 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.72 
 
 		 337 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.58 
 
 		 332 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  30.16 
 
 		 558 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  25.62 
 
 		 330 aa  126  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  29.38 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.02 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  26.16 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.55 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.18 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  31.58 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  28.9 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  26.48 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.41 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  26.51 
 
 		 331 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  26.74 
 
 		 330 aa  115  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.78 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  26.72 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  26.9 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.9 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0161  hypothetical protein  28.32 
 
 		 330 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  33.66 
 
 		 207 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.22 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.68 
 
 		 330 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  28.4 
 
 		 691 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>