More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1636 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  542  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  42.46 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  44.84 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  44.84 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  42.45 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  43.38 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  44.49 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  42.92 
 
 		 234 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 251 aa  155  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  43.84 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5125  GntR domain-containing protein  42.47 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0978  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 234 aa  148  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0479  GntR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2012  GntR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.888081  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0889  GntR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0578  GntR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0437  GntR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1856  GntR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1919  GntR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4549  GntR domain-containing protein  43.72 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3213  GntR-like  43.26 
 
 		 234 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5154  GntR domain-containing protein  43.26 
 
 		 234 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5072  GntR domain-containing protein  43.26 
 
 		 234 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  36.16 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  35.56 
 
 		 248 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  34.76 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  38.43 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  37.61 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  36.56 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  33.47 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  34.06 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  33.05 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  32.89 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  35.71 
 
 		 240 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  34.25 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  31.72 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  32 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  34.45 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  36.36 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  31.93 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.89 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  35.78 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  31.65 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  32.48 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  31.11 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  31.11 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  31.28 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  31.11 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  31.28 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  34.38 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  30.8 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 253 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  32.2 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  31.74 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  31.74 
 
 		 249 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  30.73 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  32.19 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  34.35 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1641  GntR-like  36.73 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  32.59 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  29.65 
 
 		 229 aa  99  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  29.86 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  34.67 
 
 		 233 aa  98.6  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  34.23 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  30.94 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 234 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  31.9 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  29.58 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2069  GntR domain-containing protein  33.77 
 
 		 225 aa  96.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  28.32 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  32.61 
 
 		 236 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  28.7 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  36.2 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5446  GntR domain protein  36.76 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0117781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>