61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0096 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0096  general secretion pathway protein C  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.140441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  40.36 
 
 		 305 aa  205  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  39.53 
 
 		 307 aa  202  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  38.93 
 
 		 309 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  38.93 
 
 		 309 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  37.5 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  38.59 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  38.59 
 
 		 309 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0155  general secretion pathway protein C  39.93 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0113591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0150  general secretion pathway protein C  39.93 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.752354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3620  general secretion pathway protein C  39.86 
 
 		 305 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00688552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0150  general secretion pathway protein C  39.58 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00215157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4359  general secretion pathway protein C  39.93 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  38.87 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3568  general secretion pathway protein C  39.21 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00690915  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  36.27 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0120  type II secretion system protein C  36.17 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000735781  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  35.13 
 
 		 307 aa  175  9e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  35.48 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  33.68 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  33.99 
 
 		 307 aa  161  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  34.74 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  34.51 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  36.23 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1411  general secretion pathway protein C  32.84 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3139  putative type II secretion protein GspC  29.89 
 
 		 319 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2861  general secretion pathway protein C  34.76 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3248  putative type II secretion protein GspC  31.84 
 
 		 319 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3428  putative type II secretion protein GspC  32.29 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02839  predicted secretion pathway protein, C-type protein  30.94 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02789  hypothetical protein  30.94 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000559492  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  28.68 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  27.89 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0726  general secretion pathway protein C  31.39 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1298  general secretion pathway protein C  28.94 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  27.48 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0002  general secretion pathway protein C  25.19 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.856958  normal  0.237385 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1469  general secretion pathway protein C  28.18 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0249  hypothetical protein  21.93 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00883556  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0314  type II secretion system protein C  27.87 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2028  general secretion pathway protein C  23.31 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2376  general secretion pathway protein C  25.81 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.490477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0389  general secretion pathway protein C  24.46 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000776949  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0389  general secretion pathway protein C  24.46 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125631  normal  0.017456 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1040  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  22.18 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000638276  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03175  general secretory pathway component, cryptic  24.46 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3518  general secretion pathway protein C  24.46 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000156607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03126  hypothetical protein  24.46 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.013931  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0140  general secretion pathway protein C  21.25 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2607  general secretion pathway protein C  24.55 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.867603 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2654  type II secretion system protein C  22.93 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2590  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  24.62 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0687  hypothetical protein  21.4 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259816  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1178  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.33 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0722  hypothetical protein  20.99 
 
 		 327 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0721  hypothetical protein  20.99 
 
 		 327 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  35.21 
 
 		 411 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4252  hypothetical protein  36.76 
 
 		 177 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  29.41 
 
 		 452 aa  42.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  33.8 
 
 		 483 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  33.8 
 
 		 483 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>