More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2115 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.43 
 
 
757 aa  744  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.92 
 
 
754 aa  745  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.39 
 
 
773 aa  672  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.14 
 
 
740 aa  751  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  94.25 
 
 
731 aa  1395  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.57 
 
 
757 aa  731  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  65.26 
 
 
737 aa  901  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  55.65 
 
 
739 aa  776  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  46.3 
 
 
804 aa  641  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  54.76 
 
 
704 aa  719  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  60.7 
 
 
768 aa  909  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  58.61 
 
 
719 aa  815  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.43 
 
 
730 aa  652  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.43 
 
 
740 aa  751  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.13 
 
 
742 aa  762  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.27 
 
 
772 aa  678  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  55.32 
 
 
804 aa  698  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.03 
 
 
754 aa  725  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.59 
 
 
736 aa  708  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.96 
 
 
738 aa  742  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.28 
 
 
721 aa  766  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.08 
 
 
756 aa  779  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  100 
 
 
731 aa  1458  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  50.13 
 
 
810 aa  704  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  93.02 
 
 
731 aa  1387  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  65.44 
 
 
736 aa  931  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  47.52 
 
 
829 aa  649  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  65.13 
 
 
737 aa  888  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.03 
 
 
805 aa  689  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.44 
 
 
757 aa  721  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.27 
 
 
715 aa  711  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.85 
 
 
784 aa  726  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  52.66 
 
 
732 aa  687  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.26 
 
 
806 aa  748  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.43 
 
 
810 aa  671  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.27 
 
 
808 aa  738  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  54.72 
 
 
753 aa  755  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  70.49 
 
 
732 aa  1010  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  64.49 
 
 
718 aa  893  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  65.4 
 
 
738 aa  894  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  93.3 
 
 
731 aa  1395  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  52.5 
 
 
755 aa  716  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.63 
 
 
709 aa  709  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  61.01 
 
 
852 aa  808  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  73.41 
 
 
735 aa  1083  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  55.42 
 
 
805 aa  693  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  57.83 
 
 
723 aa  805  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  63.34 
 
 
769 aa  917  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  50.68 
 
 
764 aa  736  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  59.06 
 
 
738 aa  816  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  53.58 
 
 
775 aa  775  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  51.28 
 
 
763 aa  731  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  54.27 
 
 
754 aa  767  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  58.62 
 
 
727 aa  832  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.79 
 
 
781 aa  788  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.07 
 
 
763 aa  684  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.34 
 
 
742 aa  753  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  58.56 
 
 
759 aa  850  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.5 
 
 
754 aa  729  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  53.48 
 
 
743 aa  758  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  57.85 
 
 
760 aa  849  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  55.06 
 
 
701 aa  745  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  50.42 
 
 
721 aa  709  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  46.37 
 
 
814 aa  640  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  55.18 
 
 
722 aa  773  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.55 
 
 
800 aa  687  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.13 
 
 
754 aa  723  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  53.76 
 
 
718 aa  721  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.97 
 
 
781 aa  758  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  50.56 
 
 
713 aa  707  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.07 
 
 
801 aa  688  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  45.1 
 
 
806 aa  631  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  44.59 
 
 
810 aa  628  1e-179  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.02 
 
 
801 aa  628  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  48.71 
 
 
826 aa  620  1e-176  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  45.87 
 
 
703 aa  611  1e-173  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  47.98 
 
 
699 aa  603  1e-171  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  47.46 
 
 
703 aa  601  1e-170  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  47.3 
 
 
739 aa  588  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  46.1 
 
 
746 aa  574  1e-162  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  42.14 
 
 
930 aa  553  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  53.21 
 
 
639 aa  547  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  52.36 
 
 
647 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  49.36 
 
 
788 aa  542  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  53.37 
 
 
613 aa  541  1e-152  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  45.88 
 
 
803 aa  535  1e-151  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  48.01 
 
 
685 aa  538  1e-151  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  54.14 
 
 
601 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  53.26 
 
 
776 aa  527  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  48.63 
 
 
550 aa  498  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  47.64 
 
 
691 aa  498  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  48.25 
 
 
567 aa  492  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  42.18 
 
 
832 aa  463  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  41.72 
 
 
756 aa  442  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  45.74 
 
 
729 aa  438  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  43.29 
 
 
607 aa  416  1e-115  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  41.37 
 
 
749 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40257  predicted protein  46.37 
 
 
537 aa  406  1e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  36.77 
 
 
748 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  42.15 
 
 
599 aa  398  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>