More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1108 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  527  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  71.91 
 
 
275 aa  347  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  66.24 
 
 
247 aa  340  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  63.11 
 
 
248 aa  338  6e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  62.86 
 
 
270 aa  338  7e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  56.03 
 
 
510 aa  274  1e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  54.27 
 
 
257 aa  269  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  53.5 
 
 
512 aa  268  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  58.82 
 
 
314 aa  266  3e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  58.26 
 
 
322 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  54.59 
 
 
314 aa  262  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  58.06 
 
 
322 aa  261  9e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  53.04 
 
 
312 aa  259  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  53.68 
 
 
320 aa  259  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  57.67 
 
 
322 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  54.5 
 
 
319 aa  257  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  53.28 
 
 
319 aa  255  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  50.61 
 
 
324 aa  253  2e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  53.51 
 
 
319 aa  253  2e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  54.38 
 
 
309 aa  251  9e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  52.89 
 
 
316 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  52.68 
 
 
322 aa  248  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  55.11 
 
 
333 aa  248  8e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  52.94 
 
 
325 aa  248  9e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  54.17 
 
 
311 aa  246  3e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  53.64 
 
 
308 aa  246  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  53.18 
 
 
350 aa  244  1e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  46.37 
 
 
582 aa  243  2e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 
578 aa  240  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  47.2 
 
 
578 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 
578 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  47.2 
 
 
578 aa  240  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 
578 aa  240  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 
578 aa  240  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  47.2 
 
 
578 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  47.2 
 
 
578 aa  240  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 
578 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  50.2 
 
 
579 aa  239  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  45.75 
 
 
576 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  45.49 
 
 
580 aa  238  7e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
580 aa  238  7e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  47.06 
 
 
580 aa  238  7e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  46.59 
 
 
578 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  46.59 
 
 
578 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  46.59 
 
 
578 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  49.38 
 
 
599 aa  236  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  46.59 
 
 
578 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  47.93 
 
 
582 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  46.84 
 
 
589 aa  236  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  45.1 
 
 
580 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  46.41 
 
 
583 aa  236  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  46.59 
 
 
578 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  51.83 
 
 
593 aa  235  5e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  47.22 
 
 
581 aa  234  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  45.71 
 
 
583 aa  234  9e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  47.04 
 
 
594 aa  234  1e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  45.8 
 
 
578 aa  233  2e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  46.15 
 
 
590 aa  232  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  47.52 
 
 
585 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  45.75 
 
 
590 aa  232  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  48.65 
 
 
314 aa  231  6e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  46.06 
 
 
585 aa  231  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  49.08 
 
 
579 aa  231  7e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  49.08 
 
 
593 aa  230  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.93 
 
 
907 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  45.38 
 
 
575 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  46.59 
 
 
576 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  47.71 
 
 
307 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  45.64 
 
 
580 aa  228  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  42.86 
 
 
580 aa  228  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  46.03 
 
 
933 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  45.12 
 
 
914 aa  227  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  45.83 
 
 
921 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  47.06 
 
 
912 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  44.64 
 
 
255 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  47.28 
 
 
1017 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  45.2 
 
 
599 aa  225  5e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  44.75 
 
 
904 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  46.64 
 
 
924 aa  224  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  47.01 
 
 
922 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  47.01 
 
 
918 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  48.26 
 
 
651 aa  224  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  45.56 
 
 
1071 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  45.56 
 
 
1079 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  45.35 
 
 
911 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  45.56 
 
 
1071 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  47.64 
 
 
1089 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  47.64 
 
 
1066 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  47.64 
 
 
1082 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  45.16 
 
 
912 aa  222  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  47.44 
 
 
916 aa  222  5e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  44.31 
 
 
911 aa  222  5e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  44.31 
 
 
911 aa  222  5e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  44.31 
 
 
911 aa  222  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  44.31 
 
 
911 aa  222  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  43.9 
 
 
911 aa  221  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  43.9 
 
 
911 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
308 aa  221  7e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  9.93133e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  43.9 
 
 
911 aa  221  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  52.34 
 
 
578 aa  221  7e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>