227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_06243 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  100 
 
 		 219 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  100 
 
 		 219 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  52.02 
 
 		 212 aa  192  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  39.73 
 
 		 231 aa  134  9e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  38.94 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  40.87 
 
 		 244 aa  85.1  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  40.87 
 
 		 244 aa  85.1  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  49.37 
 
 		 184 aa  84.7  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  46.84 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  46.84 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  41.41 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  52.56 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  44.25 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  47.44 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  39.77 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  37.62 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  45.45 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  33.12 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  33.12 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  44.16 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  44.16 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  41.77 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  44.87 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  43.42 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  46.05 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  46.67 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  43.59 
 
 		 137 aa  67  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  43.42 
 
 		 273 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  43.42 
 
 		 285 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  46.05 
 
 		 286 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  38.74 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  45.45 
 
 		 275 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  41.18 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  42.11 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  46.05 
 
 		 275 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  42.11 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  40.79 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  41.53 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  35.82 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  44.16 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  42.67 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  34.69 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  44.74 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  40.79 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  41.77 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  44.74 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  41.77 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  44.74 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  36.84 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  37.61 
 
 		 441 aa  62  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  41.1 
 
 		 507 aa  61.6  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  43.42 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  41.33 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  43.42 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  42.67 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  40.74 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  43.42 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  36 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  38.16 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  28.67 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  37.5 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  42.31 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  38.16 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  41.56 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  28.79 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  41.33 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  43.55 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  40.54 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  37.8 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  36.71 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  33.33 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  35.56 
 
 		 112 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  37.8 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  37.8 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  30 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  36.84 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  37.18 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  37.8 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  40.54 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  36.05 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  39.47 
 
 		 269 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  40.79 
 
 		 390 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  37.8 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  37.8 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  39.47 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  38.16 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  37.8 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  46.05 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  38.89 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  32.5 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  40.22 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  38.89 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  33.33 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  36.36 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  38.75 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  41.1 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  36.14 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  40.54 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  43.42 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  38.67 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>