170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0838 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  100 
 
 		 397 aa  779    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1837  fucose permease  26.61 
 
 		 402 aa  131  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0765737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1651  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 422 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0839039  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0874  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.499239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0364  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2712  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0893626  normal  0.189782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4635  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0839112  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  23.88 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1706  signal peptide and transmembrane prediction  25 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.873275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3127  transport protein  24.35 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1636  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2340  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0723  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475957 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0040  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3382  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3437  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  22.42 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  23.05 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0222  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  25.15 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1346  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  24.92 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  21.69 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  25.46 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5059  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  21.32 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  23.53 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  23.68 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  22.4 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  23.22 
 
 		 410 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  22.14 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  23.74 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  22.95 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  22.18 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  20.33 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2058  major facilitator family protein  23.44 
 
 		 415 aa  53.1  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0107331  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 326 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  23.39 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  23.64 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  23.66 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  28.29 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  23.65 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  25.38 
 
 		 415 aa  50.1  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  25.38 
 
 		 415 aa  50.1  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  21.79 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0939  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 417 aa  49.7  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 419 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  23.08 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03949  osmolarity sensor protein  26.19 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  24.89 
 
 		 414 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2631  twin-arginine translocation pathway signal  26.05 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.774949  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  23.35 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  22.53 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0483  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 		 354 aa  47.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  25.45 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  24.37 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2681  hypothetical protein  23.08 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.433082  hitchhiker  0.00146512 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  23.22 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  22.22 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  23.66 
 
 		 500 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  23.12 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  20.65 
 
 		 431 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2019  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 556 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  27.81 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1790  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  25.45 
 
 		 394 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  23.03 
 
 		 403 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  25.4 
 
 		 500 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 398 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  23.03 
 
 		 403 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  21.43 
 
 		 402 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 402 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>