12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0874 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0874  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 423 aa  794    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.499239 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1837  fucose permease  42.2 
 
 		 402 aa  293  5e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0765737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1651  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 422 aa  290  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0839039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  29.86 
 
 		 397 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0723  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475957 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  29.62 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1706  signal peptide and transmembrane prediction  25.07 
 
 		 400 aa  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.873275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2712  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0893626  normal  0.189782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0040  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3127  transport protein  22.76 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0872  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0910499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>