More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_87381 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_09120  DNA-directed RNA polymerase Fragment (EC 2.7.7.6) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV95]  34.21 
 
 
1252 aa  709    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00321  DNA-directed RNA polymerase III, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02460)  65.91 
 
 
1225 aa  1570    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0578929  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1204  DNA-directed RNA polymerase subunit B  35.47 
 
 
1124 aa  695    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.074104  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00420  DNA-directed RNA polymerase, putative  62.71 
 
 
1129 aa  1434    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1963  DNA-directed RNA polymerase subunit B  37.25 
 
 
1127 aa  733    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2321  DNA-directed RNA polymerase subunit B  37.26 
 
 
1127 aa  734    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.388752  hitchhiker  0.000074653 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54289  predicted protein  51.68 
 
 
1211 aa  1248    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0347  DNA-directed RNA polymerase subunit B  36.38 
 
 
1115 aa  702    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87381  DNA-directed RNA polymerase III  100 
 
 
1155 aa  2400    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200295  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1091  DNA-directed RNA polymerase subunit B  35.6 
 
 
1201 aa  677    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00610767  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2091  DNA-directed RNA polymerase subunit B  37.47 
 
 
1127 aa  739    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0449  DNA-directed RNA polymerase subunit B  37.64 
 
 
1131 aa  743    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000490732  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13673  predicted protein  37.05 
 
 
1174 aa  746    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320085  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0033  DNA-directed RNA polymerase subunit B  36.36 
 
 
1124 aa  703    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000339757  normal  0.0488457 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0286  DNA-directed RNA polymerase subunit B  36.75 
 
 
1130 aa  740    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0703  DNA-directed RNA polymerase subunit B  37.31 
 
 
1127 aa  739    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.347908  decreased coverage  0.0027158 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39835  predicted protein  58.17 
 
 
1146 aa  1363    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.695228  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34146  DNA-dependent RNA polymerase II  36.3 
 
 
1232 aa  723    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.19062  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11441  predicted protein  35.82 
 
 
1212 aa  718    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.41683  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03540  DNA-dependent RNA polymerase II RPB140, putative  40.36 
 
 
1193 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.85133  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3693  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  43.04 
 
 
604 aa  501  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.256816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0028  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  44.08 
 
 
604 aa  500  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.274287  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0790  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  43 
 
 
611 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0783  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  43.2 
 
 
608 aa  492  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0514  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  41.59 
 
 
608 aa  489  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0672  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  43.41 
 
 
611 aa  484  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2151  DNA-directed RNA polymerase subunit B  41.73 
 
 
609 aa  480  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0352  DNA-directed RNA polymerase subunit B  41.72 
 
 
609 aa  481  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0216  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  42.83 
 
 
611 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1933  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  42.79 
 
 
604 aa  481  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1311  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  43 
 
 
611 aa  481  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0106  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  42.81 
 
 
609 aa  478  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.49863  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1178  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  42.63 
 
 
604 aa  478  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000367699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2160  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  41.98 
 
 
604 aa  474  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0554265  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0607  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  42.67 
 
 
611 aa  476  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1162  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  41.32 
 
 
637 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.595392 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0299  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  42.43 
 
 
604 aa  465  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0313  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  42.43 
 
 
604 aa  465  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0051  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  41.79 
 
 
606 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9235  predicted protein  29.35 
 
 
1147 aa  427  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04080  DNA-directed RNA polymerase i polypeptide 2, putative  29.48 
 
 
1193 aa  416  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0866247  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77977  DNA-directed RNA polymerase I  29.66 
 
 
1167 aa  405  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.481222 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03933  DNA-directed RNA polymerase I subunit beta (Rpa2), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08300)  29.7 
 
 
1231 aa  390  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119522  DNA-directed RNA polymerase I polypeptide 2  28.16 
 
 
1145 aa  384  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.050944  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0791  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  32.35 
 
 
510 aa  248  4e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1179  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  32.19 
 
 
542 aa  242  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3694  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  32.86 
 
 
531 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0107  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  31.52 
 
 
521 aa  242  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.397905  normal  0.532786 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0217  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  32.81 
 
 
499 aa  241  5e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408076  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0606  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  32.61 
 
 
499 aa  239  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1312  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  32.61 
 
 
499 aa  238  4e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0671  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  32.02 
 
 
499 aa  238  7e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0515  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  29.85 
 
 
520 aa  235  4.0000000000000004e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2150  RNA polymerase beta subunit  29.92 
 
 
526 aa  230  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0784  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  28.49 
 
 
521 aa  228  4e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0351  RNA polymerase beta subunit  29.49 
 
 
524 aa  226  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0027  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  30.71 
 
 
496 aa  222  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.483388  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1934  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  29.1 
 
 
522 aa  203  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0050  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  28.57 
 
 
518 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1163  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  28.11 
 
 
516 aa  196  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.552918 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2159  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  27.57 
 
 
503 aa  193  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34527  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0298  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  27.5 
 
 
513 aa  188  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.992089  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0312  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  27.5 
 
 
513 aa  188  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0414  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.41 
 
 
1115 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0178041  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1532  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  32.62 
 
 
1126 aa  186  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1825  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.9 
 
 
1202 aa  182  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0312  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.63 
 
 
1246 aa  182  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1375  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit  30.52 
 
 
1197 aa  182  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0099  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.96 
 
 
1190 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf212  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.11 
 
 
1197 aa  180  1e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2724  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.45 
 
 
1250 aa  180  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.280863  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1705  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.52 
 
 
1124 aa  180  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1079  DNA-directed RNA polymerase  24.98 
 
 
1155 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715503  normal  0.276189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0804  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.46 
 
 
1228 aa  181  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0442499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2719  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  31.34 
 
 
1176 aa  180  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0103  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.74 
 
 
1185 aa  179  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000686573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0859  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.37 
 
 
1238 aa  179  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111826  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1958  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  33.15 
 
 
1173 aa  178  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0680  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.99 
 
 
1171 aa  177  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0160  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.64 
 
 
1191 aa  177  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl598  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.11 
 
 
1284 aa  177  9.999999999999999e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1845  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  28.62 
 
 
1193 aa  177  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1492  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.41 
 
 
1202 aa  177  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1169  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  23.97 
 
 
1188 aa  176  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0246464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2468  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.13 
 
 
1141 aa  175  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0543  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  24.39 
 
 
1155 aa  175  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174564  normal  0.14479 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1981  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.2 
 
 
1196 aa  174  9e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6057  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  25.5 
 
 
1141 aa  173  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0278  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.23 
 
 
1227 aa  173  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00054451  hitchhiker  0.000191986 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0284  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.39 
 
 
1212 aa  172  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000140323 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2341  DNA-directed RNA polymerase  28.57 
 
 
1107 aa  172  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0186  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  31.9 
 
 
1174 aa  172  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0183  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.61 
 
 
1183 aa  171  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0702536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0565  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.84 
 
 
1183 aa  171  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1396  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.37 
 
 
1286 aa  171  8e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0579  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.84 
 
 
1183 aa  171  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.38 
 
 
1177 aa  170  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.907147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.38 
 
 
1177 aa  170  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0098  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.38 
 
 
1177 aa  170  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0114  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.38 
 
 
1130 aa  171  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.65239e-57 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>