More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1705 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.68 
 
 		 1145 aa  1160    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000841151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3933  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.7 
 
 		 1143 aa  1123    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.854688  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0589  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.71 
 
 		 1252 aa  739    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0603  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.88 
 
 		 1272 aa  1061    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2863  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.84 
 
 		 1370 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4463  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.29 
 
 		 1343 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2421  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.45 
 
 		 1167 aa  879    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.142717  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0183  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  57.68 
 
 		 1183 aa  941    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0702536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0565  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  57.93 
 
 		 1183 aa  941    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2729  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  53.59 
 
 		 1362 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.466939 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.15 
 
 		 1177 aa  947    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.907147  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3364  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.05 
 
 		 1358 aa  652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209145 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0160  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.48 
 
 		 1191 aa  918    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1243  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.37 
 
 		 1377 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.510388  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0224  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.12 
 
 		 1345 aa  636    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0193  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.29 
 
 		 1322 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146327  hitchhiker  0.0018171 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.27 
 
 		 1177 aa  947    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0098  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.15 
 
 		 1177 aa  947    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl598  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.99 
 
 		 1284 aa  838    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0096  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.15 
 
 		 1177 aa  947    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.13 
 
 		 1174 aa  1107    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0605321 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1061  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.23 
 
 		 1370 aa  647    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.449101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.71 
 
 		 1177 aa  1096    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0579  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.05 
 
 		 1183 aa  944    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2654  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.6 
 
 		 1155 aa  1122    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679256  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1016  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.54 
 
 		 1095 aa  1045    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0988562  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18861  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.54 
 
 		 1095 aa  1046    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.816976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0151  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.78 
 
 		 1343 aa  642    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1350  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.17 
 
 		 1380 aa  644    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0511813  normal  0.845887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.65 
 
 		 1117 aa  1049    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16071  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.63 
 
 		 1096 aa  1046    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.614693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16651  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.45 
 
 		 1097 aa  1049    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16891  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.49 
 
 		 1097 aa  1049    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1699  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.9 
 
 		 1377 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0694  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.06 
 
 		 1368 aa  643    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.46808  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1205  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.37 
 
 		 1377 aa  637    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.130962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1962  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.68 
 
 		 1301 aa  681    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.768715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0605  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.72 
 
 		 1097 aa  1037    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0357  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.89 
 
 		 1300 aa  672    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2067  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.54 
 
 		 1097 aa  1035    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.883429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0619  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.25 
 
 		 1370 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000502856 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0339  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.9 
 
 		 1377 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.27 
 
 		 1177 aa  947    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1578  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.89 
 
 		 1097 aa  1061    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.702205  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1522  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.66 
 
 		 1100 aa  1075    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.18343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4325  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.65 
 
 		 1143 aa  1117    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.0767673 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0070  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.8 
 
 		 1287 aa  871    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2695  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.21 
 
 		 1393 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2468  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.36 
 
 		 1141 aa  1202    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1598  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.12 
 
 		 1245 aa  710    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0310456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1592  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.3 
 
 		 1422 aa  672    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.657994  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0573  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.97 
 
 		 1141 aa  1111    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2285  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.81 
 
 		 1390 aa  638    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0576876  normal  0.366235 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0216  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.8 
 
 		 1183 aa  1127    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.846031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0244  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.46 
 
 		 1217 aa  661    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1016  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.17 
 
 		 1122 aa  1050    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2542  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.07 
 
 		 1377 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0163  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.45 
 
 		 1343 aa  636    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0257445  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3195  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.64 
 
 		 1374 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1531  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.77 
 
 		 1380 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0680  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.27 
 
 		 1171 aa  1084    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2724  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  61.03 
 
 		 1250 aa  983    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.280863  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16761  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.45 
 
 		 1097 aa  1053    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0636  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  69.42 
 
 		 1152 aa  1592    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0189  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.29 
 
 		 1343 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230411  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1486  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.65 
 
 		 1392 aa  652    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.792933  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0462  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.31 
 
 		 1263 aa  850    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0969  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.26 
 
 		 1166 aa  1106    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2162  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  51.25 
 
 		 1141 aa  1073    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.906254  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2221  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.9 
 
 		 1416 aa  659    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480629  decreased coverage  0.00212341 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2722  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  59.48 
 
 		 1234 aa  952    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.304828  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2408  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  59.48 
 
 		 1234 aa  952    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154863  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0578  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.96 
 
 		 1240 aa  1061    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219767  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2939  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.6 
 
 		 1102 aa  1030    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3687  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  58.44 
 
 		 1278 aa  930    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0355  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  48.07 
 
 		 1187 aa  827    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1782  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.33 
 
 		 1182 aa  830    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0141  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.95 
 
 		 1343 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.683785  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2341  DNA-directed RNA polymerase  52.54 
 
 		 1107 aa  1132    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1802  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.94 
 
 		 1357 aa  636    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.817598  normal  0.172687 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1492  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.49 
 
 		 1202 aa  949    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04361  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.16 
 
 		 1097 aa  1053    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1981  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.62 
 
 		 1196 aa  1089    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1375  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit  57.76 
 
 		 1197 aa  933    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0284  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.73 
 
 		 1212 aa  1071    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140323 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1825  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.51 
 
 		 1202 aa  927    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1845  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.65 
 
 		 1193 aa  918    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2984  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.74 
 
 		 1171 aa  1072    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.816436  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10681  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.48 
 
 		 1178 aa  1085    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0353  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.9 
 
 		 1377 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1265  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  57.59 
 
 		 1229 aa  701    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0859  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  61.08 
 
 		 1238 aa  982    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111826  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0299  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.29 
 
 		 1169 aa  1115    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.289387 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0233  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.66 
 
 		 1312 aa  686    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0502  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.28 
 
 		 1172 aa  854    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145308  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0711  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.49 
 
 		 1166 aa  1110    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0997  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.26 
 
 		 1172 aa  1107    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0987  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.26 
 
 		 1172 aa  1107    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5081  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.84 
 
 		 1372 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563894  normal  0.835448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1257  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.43 
 
 		 1161 aa  1112    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>