More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0671 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0791  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  76.79 
 
 
510 aa  811    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0671  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  100 
 
 
499 aa  1027    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0606  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  92.77 
 
 
499 aa  969    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0217  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  92.17 
 
 
499 aa  966    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408076  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1312  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  92.77 
 
 
499 aa  968    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0027  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  55.69 
 
 
496 aa  560  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.483388  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3694  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  53.53 
 
 
531 aa  538  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1179  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  53.39 
 
 
542 aa  529  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1204  DNA-directed RNA polymerase subunit B  51.02 
 
 
1124 aa  513  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.074104  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0515  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  51.42 
 
 
520 aa  509  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2150  RNA polymerase beta subunit  51.62 
 
 
526 aa  509  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0107  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  49.9 
 
 
521 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.397905  normal  0.532786 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0351  RNA polymerase beta subunit  50.82 
 
 
524 aa  502  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0784  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  50.89 
 
 
521 aa  504  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0033  DNA-directed RNA polymerase subunit B  49.9 
 
 
1124 aa  500  1e-140  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000339757  normal  0.0488457 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1163  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  48.93 
 
 
516 aa  499  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.552918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0312  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  49.03 
 
 
513 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0298  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  49.03 
 
 
513 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.992089  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0050  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  47.78 
 
 
518 aa  489  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2159  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  48.21 
 
 
503 aa  488  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34527  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1934  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  47.93 
 
 
522 aa  484  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0286  DNA-directed RNA polymerase subunit B  48.56 
 
 
1130 aa  483  1e-135  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1091  DNA-directed RNA polymerase subunit B  47.71 
 
 
1201 aa  476  1e-133  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00610767  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1963  DNA-directed RNA polymerase subunit B  45.78 
 
 
1127 aa  434  1e-120  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2091  DNA-directed RNA polymerase subunit B  45.36 
 
 
1127 aa  432  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0703  DNA-directed RNA polymerase subunit B  45.67 
 
 
1127 aa  435  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.347908  decreased coverage  0.0027158 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2321  DNA-directed RNA polymerase subunit B  44.67 
 
 
1127 aa  430  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.388752  hitchhiker  0.000074653 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0347  DNA-directed RNA polymerase subunit B  45.73 
 
 
1115 aa  427  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0449  DNA-directed RNA polymerase subunit B  43.2 
 
 
1131 aa  419  1e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000490732  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13673  predicted protein  35.59 
 
 
1174 aa  319  6e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320085  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34146  DNA-dependent RNA polymerase II  33.9 
 
 
1232 aa  296  4e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.19062  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11441  predicted protein  32.78 
 
 
1212 aa  290  5.0000000000000004e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.41683  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09120  DNA-directed RNA polymerase Fragment (EC 2.7.7.6) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV95]  31.89 
 
 
1252 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39835  predicted protein  33.79 
 
 
1146 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.695228  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00420  DNA-directed RNA polymerase, putative  34.12 
 
 
1129 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54289  predicted protein  32.35 
 
 
1211 aa  265  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87381  DNA-directed RNA polymerase III  32.02 
 
 
1155 aa  238  3e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200295  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00321  DNA-directed RNA polymerase III, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02460)  30.86 
 
 
1225 aa  233  5e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0578929  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03540  DNA-dependent RNA polymerase II RPB140, putative  29.02 
 
 
1193 aa  231  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.85133  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0714  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  26.02 
 
 
1178 aa  130  8.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0122097  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19910  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.11 
 
 
1185 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.168959  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2468  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.37 
 
 
1141 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0299  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.25 
 
 
1169 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.289387 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01090  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  25.96 
 
 
1090 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000929297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0278  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.71 
 
 
1227 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00054451  hitchhiker  0.000191986 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03810  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  25.56 
 
 
1178 aa  123  7e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000134486  normal  0.250195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.44 
 
 
1145 aa  123  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000841151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0414  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.3 
 
 
1115 aa  123  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0178041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2341  DNA-directed RNA polymerase  25.6 
 
 
1107 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0244  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  25.94 
 
 
1217 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1063  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  25.16 
 
 
1149 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613328  normal  0.794281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3155  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.65 
 
 
1169 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.268483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0543  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  25.83 
 
 
1155 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174564  normal  0.14479 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0708  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  25.9 
 
 
1203 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1532  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  27.03 
 
 
1126 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16651  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.87 
 
 
1097 aa  113  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2162  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  23.09 
 
 
1141 aa  113  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.906254  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16071  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.94 
 
 
1096 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.614693  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16891  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.4 
 
 
1097 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2707  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  24.12 
 
 
1227 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.608751  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6057  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.19 
 
 
1141 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1578  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.64 
 
 
1097 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.702205  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0216  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.75 
 
 
1183 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.846031  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4519  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  24.42 
 
 
1169 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16761  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.64 
 
 
1097 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2654  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  24.23 
 
 
1155 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679256  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9235  predicted protein  25.91 
 
 
1147 aa  110  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1016  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.64 
 
 
1095 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0988562  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0974  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  25.2 
 
 
1070 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000799261  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18861  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.64 
 
 
1095 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.816976  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04361  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.87 
 
 
1097 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2067  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.4 
 
 
1097 aa  110  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.883429  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0605  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.4 
 
 
1097 aa  110  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0573  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.67 
 
 
1141 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10681  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.91 
 
 
1178 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0603  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.69 
 
 
1272 aa  109  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_543  DNA-directed RNA polymerase beta subunit  23.74 
 
 
1272 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.195704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1079  DNA-directed RNA polymerase  23.25 
 
 
1155 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715503  normal  0.276189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0680  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  25.05 
 
 
1171 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0620  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  24.48 
 
 
1165 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1522  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.2 
 
 
1100 aa  107  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.18343 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1192  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  23.37 
 
 
1201 aa  107  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0580  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  24.66 
 
 
1170 aa  107  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0311917 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0578  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.98 
 
 
1240 aa  107  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219767  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03800  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.92 
 
 
1170 aa  107  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1327  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  24.08 
 
 
1192 aa  106  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.2 
 
 
1174 aa  106  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0605321 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0619  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.64 
 
 
1370 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000502856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0969  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.8 
 
 
1166 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0997  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.8 
 
 
1172 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249941  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2667  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  24.28 
 
 
1168 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0987  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.8 
 
 
1172 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1257  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.46 
 
 
1161 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.568598 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03933  DNA-directed RNA polymerase I subunit beta (Rpa2), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08300)  23.36 
 
 
1231 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5116  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  24.02 
 
 
1155 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.303948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6627  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  23.74 
 
 
1160 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357912  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2697  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  24.61 
 
 
1169 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.275742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23930  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  24.17 
 
 
1162 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1265  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  24.13 
 
 
1229 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17250  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  24.04 
 
 
1168 aa  103  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>