More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1091 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_09120  DNA-directed RNA polymerase Fragment (EC 2.7.7.6) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV95]  36.19 
 
 		 1252 aa  744    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00321  DNA-directed RNA polymerase III, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02460)  33.85 
 
 		 1225 aa  667    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0578929  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1204  DNA-directed RNA polymerase subunit B  48.02 
 
 		 1124 aa  1112    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.074104  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54289  predicted protein  36.87 
 
 		 1211 aa  697    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0299  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  56.19 
 
 		 604 aa  739    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0672  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  56.99 
 
 		 611 aa  726    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03540  DNA-dependent RNA polymerase II RPB140, putative  35.59 
 
 		 1193 aa  685    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.85133  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00420  DNA-directed RNA polymerase, putative  36.23 
 
 		 1129 aa  691    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34146  DNA-dependent RNA polymerase II  37.21 
 
 		 1232 aa  762    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.19062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0106  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  57.59 
 
 		 609 aa  741    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.49863  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3693  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  57.98 
 
 		 604 aa  764    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.256816 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13673  predicted protein  38.43 
 
 		 1174 aa  787    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320085  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0033  DNA-directed RNA polymerase subunit B  48.1 
 
 		 1124 aa  1108    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000339757  normal  0.0488457 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1311  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  55.78 
 
 		 611 aa  721    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0216  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  56.24 
 
 		 611 aa  723    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2321  DNA-directed RNA polymerase subunit B  46.89 
 
 		 1127 aa  1024    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.388752  hitchhiker  0.000074653 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39835  predicted protein  36.54 
 
 		 1146 aa  715    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.695228  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2160  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  56.35 
 
 		 604 aa  743    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0554265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0313  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  56.19 
 
 		 604 aa  739    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0051  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  56.35 
 
 		 606 aa  726    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0514  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  56.86 
 
 		 608 aa  746    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1178  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  56.12 
 
 		 604 aa  741    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000367699  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0607  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  55.93 
 
 		 611 aa  721    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1933  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  55.42 
 
 		 604 aa  733    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0783  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  56.7 
 
 		 608 aa  739    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0790  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  53.76 
 
 		 611 aa  710    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0352  DNA-directed RNA polymerase subunit B  58.05 
 
 		 609 aa  751    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0347  DNA-directed RNA polymerase subunit B  44.7 
 
 		 1115 aa  962    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0028  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  59.69 
 
 		 604 aa  781    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.274287  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1091  DNA-directed RNA polymerase subunit B  100 
 
 		 1201 aa  2468    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00610767  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0449  DNA-directed RNA polymerase subunit B  47.74 
 
 		 1131 aa  1027    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000490732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0286  DNA-directed RNA polymerase subunit B  46.18 
 
 		 1130 aa  1040    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2151  DNA-directed RNA polymerase subunit B  57.89 
 
 		 609 aa  752    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0703  DNA-directed RNA polymerase subunit B  47.22 
 
 		 1127 aa  1033    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.347908  decreased coverage  0.0027158 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1963  DNA-directed RNA polymerase subunit B  46.73 
 
 		 1127 aa  1023    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11441  predicted protein  35 
 
 		 1212 aa  701    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.41683  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2091  DNA-directed RNA polymerase subunit B  46.52 
 
 		 1127 aa  1023    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1162  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  52.72 
 
 		 637 aa  717    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.595392 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87381  DNA-directed RNA polymerase III  35.6 
 
 		 1155 aa  677    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3694  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  48.69 
 
 		 531 aa  480  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0791  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  48.27 
 
 		 510 aa  474  1e-132  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0671  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  47.71 
 
 		 499 aa  476  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1179  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  47.09 
 
 		 542 aa  474  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0027  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  45.81 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.483388  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0217  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  46.97 
 
 		 499 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408076  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0606  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  46.79 
 
 		 499 aa  466  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1312  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  46.79 
 
 		 499 aa  465  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0298  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  42.78 
 
 		 513 aa  446  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.992089  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0312  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  42.78 
 
 		 513 aa  446  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0050  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  42.6 
 
 		 518 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1934  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  46.15 
 
 		 522 aa  439  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2150  RNA polymerase beta subunit  43.73 
 
 		 526 aa  439  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2159  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  45.14 
 
 		 503 aa  439  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0351  RNA polymerase beta subunit  43.54 
 
 		 524 aa  437  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1163  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  41.95 
 
 		 516 aa  439  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.552918 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0515  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  42.88 
 
 		 520 aa  431  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0107  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  43.3 
 
 		 521 aa  432  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.397905  normal  0.532786 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0784  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  43.46 
 
 		 521 aa  428  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119522  DNA-directed RNA polymerase I polypeptide 2  27.74 
 
 		 1145 aa  331  6e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.050944  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9235  predicted protein  36.65 
 
 		 1147 aa  321  7e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04080  DNA-directed RNA polymerase i polypeptide 2, putative  38.55 
 
 		 1193 aa  312  2.9999999999999997e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0866247  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77977  DNA-directed RNA polymerase I  36.95 
 
 		 1167 aa  310  9e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.481222 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03933  DNA-directed RNA polymerase I subunit beta (Rpa2), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08300)  36.9 
 
 		 1231 aa  307  6e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2707  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  25.53 
 
 		 1227 aa  254  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.608751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1492  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.62 
 
 		 1202 aa  221  8.999999999999998e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1375  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit  31.63 
 
 		 1197 aa  214  9e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1825  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  36.65 
 
 		 1202 aa  211  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1958  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  37.5 
 
 		 1173 aa  210  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2724  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.3 
 
 		 1250 aa  210  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.280863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2468  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.03 
 
 		 1141 aa  207  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716537 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01090  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  36.62 
 
 		 1090 aa  207  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000929297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0312  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  35.21 
 
 		 1246 aa  207  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2719  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  33.81 
 
 		 1176 aa  206  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1981  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  28.95 
 
 		 1196 aa  206  3e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1532  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  34.38 
 
 		 1126 aa  205  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0160  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  34.14 
 
 		 1191 aa  205  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0804  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  37.22 
 
 		 1228 aa  204  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0442499  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1845  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  36.08 
 
 		 1193 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0859  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  36.93 
 
 		 1238 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0414  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.41 
 
 		 1115 aa  201  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0178041  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0284  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  28.78 
 
 		 1212 aa  201  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140323 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0183  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  35.39 
 
 		 1183 aa  199  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0702536  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  35.77 
 
 		 1145 aa  200  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000841151  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0565  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.09 
 
 		 1183 aa  199  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2722  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  34.65 
 
 		 1234 aa  200  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.304828  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2408  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  34.65 
 
 		 1234 aa  200  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154863  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0579  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.09 
 
 		 1183 aa  199  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0099  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  34.73 
 
 		 1190 aa  199  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0103  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.54 
 
 		 1185 aa  197  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000686573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0114  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.46 
 
 		 1130 aa  195  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.65239e-57 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0123  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.7 
 
 		 1177 aa  195  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.46 
 
 		 1177 aa  195  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.907147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0098  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.46 
 
 		 1177 aa  195  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0096  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.46 
 
 		 1177 aa  195  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5203  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.7 
 
 		 1177 aa  195  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000890566  unclonable  1.148e-23 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0070  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  36.69 
 
 		 1287 aa  195  4e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0133  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.46 
 
 		 1177 aa  195  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000446144  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.46 
 
 		 1177 aa  195  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.46 
 
 		 1177 aa  195  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl598  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  36.13 
 
 		 1284 aa  194  7e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>