More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1162 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0672  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  55.09 
 
 
611 aa  717    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1204  DNA-directed RNA polymerase subunit B  52.2 
 
 
1124 aa  664    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.074104  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1311  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  54.93 
 
 
611 aa  716    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3693  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  62.18 
 
 
604 aa  821    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.256816 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0607  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  54.77 
 
 
611 aa  712    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0313  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  75.39 
 
 
604 aa  998    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0033  DNA-directed RNA polymerase subunit B  51.65 
 
 
1124 aa  651    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000339757  normal  0.0488457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0051  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  72.53 
 
 
606 aa  963    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1178  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  60.76 
 
 
604 aa  796    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000367699  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0216  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  55.09 
 
 
611 aa  717    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2151  DNA-directed RNA polymerase subunit B  59.87 
 
 
609 aa  793    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1933  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  74.13 
 
 
604 aa  979    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0514  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  59.15 
 
 
608 aa  781    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0028  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  62.03 
 
 
604 aa  822    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.274287  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0790  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  55.69 
 
 
611 aa  726    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2160  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  73.03 
 
 
604 aa  959    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0554265  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1091  DNA-directed RNA polymerase subunit B  52.72 
 
 
1201 aa  717    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00610767  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0106  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  56.99 
 
 
609 aa  749    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.49863  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0299  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  75.39 
 
 
604 aa  998    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0783  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  59.15 
 
 
608 aa  776    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0352  DNA-directed RNA polymerase subunit B  59.87 
 
 
609 aa  790    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1162  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  100 
 
 
637 aa  1312    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.595392 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0703  DNA-directed RNA polymerase subunit B  50 
 
 
1127 aa  623  1e-177  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.347908  decreased coverage  0.0027158 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0286  DNA-directed RNA polymerase subunit B  48.22 
 
 
1130 aa  618  1e-176  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2321  DNA-directed RNA polymerase subunit B  49.45 
 
 
1127 aa  616  1e-175  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.388752  hitchhiker  0.000074653 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2091  DNA-directed RNA polymerase subunit B  50.47 
 
 
1127 aa  618  1e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1963  DNA-directed RNA polymerase subunit B  49.53 
 
 
1127 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0449  DNA-directed RNA polymerase subunit B  48.51 
 
 
1131 aa  604  1.0000000000000001e-171  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000490732  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0347  DNA-directed RNA polymerase subunit B  45.17 
 
 
1115 aa  598  1e-170  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03540  DNA-dependent RNA polymerase II RPB140, putative  41.01 
 
 
1193 aa  499  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.85133  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34146  DNA-dependent RNA polymerase II  39.77 
 
 
1232 aa  495  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.19062  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13673  predicted protein  40.22 
 
 
1174 aa  490  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320085  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39835  predicted protein  38.7 
 
 
1146 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.695228  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87381  DNA-directed RNA polymerase III  41.32 
 
 
1155 aa  472  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200295  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00420  DNA-directed RNA polymerase, putative  40.89 
 
 
1129 aa  468  9.999999999999999e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09120  DNA-directed RNA polymerase Fragment (EC 2.7.7.6) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV95]  39.53 
 
 
1252 aa  462  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54289  predicted protein  39.14 
 
 
1211 aa  456  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11441  predicted protein  39.14 
 
 
1212 aa  457  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.41683  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00321  DNA-directed RNA polymerase III, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02460)  39.74 
 
 
1225 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0578929  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03933  DNA-directed RNA polymerase I subunit beta (Rpa2), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08300)  36.95 
 
 
1231 aa  302  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04080  DNA-directed RNA polymerase i polypeptide 2, putative  33.45 
 
 
1193 aa  300  4e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0866247  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77977  DNA-directed RNA polymerase I  35.28 
 
 
1167 aa  300  5e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.481222 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9235  predicted protein  34.21 
 
 
1147 aa  299  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119522  DNA-directed RNA polymerase I polypeptide 2  33.21 
 
 
1145 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.050944  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1825  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  28.84 
 
 
1202 aa  210  6e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1492  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  27.34 
 
 
1202 aa  201  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2719  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  33.33 
 
 
1176 aa  201  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1981  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.79 
 
 
1196 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01090  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  33.18 
 
 
1090 aa  197  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000929297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0414  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.03 
 
 
1115 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0178041  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0312  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.11 
 
 
1246 aa  196  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0804  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.85 
 
 
1228 aa  196  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0442499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1532  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  32.58 
 
 
1126 aa  194  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0974  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  33.56 
 
 
1070 aa  194  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000799261  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2162  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  28.55 
 
 
1141 aa  194  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.906254  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2724  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  34.09 
 
 
1250 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.280863  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1192  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  28.35 
 
 
1201 aa  192  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0099  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.11 
 
 
1190 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0708  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  32.74 
 
 
1203 aa  191  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1375  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit  31.75 
 
 
1197 aa  191  4e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0821  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  28.19 
 
 
1125 aa  190  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.264809 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0103  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.11 
 
 
1185 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000686573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2468  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  27.92 
 
 
1141 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716537 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0284  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.43 
 
 
1212 aa  189  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000140323 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1705  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.41 
 
 
1124 aa  189  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0636  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.82 
 
 
1152 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0579  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.03 
 
 
1183 aa  188  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0114  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.74 
 
 
1130 aa  188  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.65239e-57 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0565  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.03 
 
 
1183 aa  188  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.74 
 
 
1177 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.907147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0098  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.74 
 
 
1177 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0133  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.74 
 
 
1177 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000446144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0096  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.74 
 
 
1177 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0123  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.74 
 
 
1177 aa  187  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.11 
 
 
1177 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5203  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.74 
 
 
1177 aa  187  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000890566  unclonable  1.148e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.74 
 
 
1177 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.74 
 
 
1177 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0183  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.81 
 
 
1183 aa  187  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0702536  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0160  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.07 
 
 
1191 aa  187  7e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0446  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  28.72 
 
 
1235 aa  187  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3687  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  32.44 
 
 
1278 aa  186  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0859  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.74 
 
 
1238 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111826  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf212  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  27.65 
 
 
1197 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1845  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.07 
 
 
1193 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2707  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.81 
 
 
1227 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.608751  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0186  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  31.52 
 
 
1174 aa  184  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0244  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.89 
 
 
1217 aa  184  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0488  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.14 
 
 
1099 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.2 
 
 
1145 aa  183  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000841151  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20950  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  27.61 
 
 
1161 aa  182  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.81555  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1598  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  32.58 
 
 
1245 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0310456  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16071  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  27.18 
 
 
1096 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.614693  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1265  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.03 
 
 
1229 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2939  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.51 
 
 
1102 aa  181  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4325  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.82 
 
 
1143 aa  180  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.0767673 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2722  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.97 
 
 
1234 aa  180  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.304828  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2408  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.97 
 
 
1234 aa  180  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154863  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0216  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.4 
 
 
1183 aa  180  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.846031  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1169  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  28.21 
 
 
1188 aa  180  9e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0246464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>