More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2321 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_09120  DNA-directed RNA polymerase Fragment (EC 2.7.7.6) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV95]  38.57 
 
 		 1252 aa  797    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00321  DNA-directed RNA polymerase III, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02460)  35.4 
 
 		 1225 aa  714    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0578929  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1204  DNA-directed RNA polymerase subunit B  53.7 
 
 		 1124 aa  1226    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.074104  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1311  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  54.39 
 
 		 611 aa  667    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13673  predicted protein  40.48 
 
 		 1174 aa  854    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320085  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0449  DNA-directed RNA polymerase subunit B  64.56 
 
 		 1131 aa  1526    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000490732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0783  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  53.81 
 
 		 608 aa  668    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2151  DNA-directed RNA polymerase subunit B  52.89 
 
 		 609 aa  656    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03540  DNA-dependent RNA polymerase II RPB140, putative  37.03 
 
 		 1193 aa  739    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.85133  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00420  DNA-directed RNA polymerase, putative  37.36 
 
 		 1129 aa  725    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0033  DNA-directed RNA polymerase subunit B  55.17 
 
 		 1124 aa  1237    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000339757  normal  0.0488457 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1963  DNA-directed RNA polymerase subunit B  91.84 
 
 		 1127 aa  2135    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3693  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  53.82 
 
 		 604 aa  660    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.256816 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0216  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  53.9 
 
 		 611 aa  664    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0514  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  53.81 
 
 		 608 aa  668    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0352  DNA-directed RNA polymerase subunit B  53.31 
 
 		 609 aa  667    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0672  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  53.72 
 
 		 611 aa  663    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34146  DNA-dependent RNA polymerase II  38.97 
 
 		 1232 aa  830    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.19062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39835  predicted protein  37.14 
 
 		 1146 aa  752    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.695228  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2160  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  51.82 
 
 		 604 aa  657    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0554265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54289  predicted protein  36.88 
 
 		 1211 aa  711    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0790  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  54.46 
 
 		 611 aa  674    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0051  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  52.25 
 
 		 606 aa  648    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1091  DNA-directed RNA polymerase subunit B  46.89 
 
 		 1201 aa  1024    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00610767  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2321  DNA-directed RNA polymerase subunit B  100 
 
 		 1127 aa  2278    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.388752  hitchhiker  0.000074653 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0106  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  53.97 
 
 		 609 aa  662    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.49863  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0347  DNA-directed RNA polymerase subunit B  46.2 
 
 		 1115 aa  1017    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1933  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  52.98 
 
 		 604 aa  669    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0028  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  56.31 
 
 		 604 aa  695    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.274287  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11441  predicted protein  39.97 
 
 		 1212 aa  814    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.41683  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0299  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  52.23 
 
 		 604 aa  655    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2091  DNA-directed RNA polymerase subunit B  93.26 
 
 		 1127 aa  2157    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0286  DNA-directed RNA polymerase subunit B  56.14 
 
 		 1130 aa  1259    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0703  DNA-directed RNA polymerase subunit B  90.86 
 
 		 1127 aa  2128    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.347908  decreased coverage  0.0027158 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87381  DNA-directed RNA polymerase III  37.26 
 
 		 1155 aa  734    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0607  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  54.23 
 
 		 611 aa  666    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0313  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  52.23 
 
 		 604 aa  655    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1178  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  51.41 
 
 		 604 aa  634  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000367699  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1162  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  49.45 
 
 		 637 aa  616  1e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.595392 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0217  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  46.48 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408076  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0606  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  45.98 
 
 		 499 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1312  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  46.08 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0791  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  44.86 
 
 		 510 aa  435  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03933  DNA-directed RNA polymerase I subunit beta (Rpa2), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08300)  30.62 
 
 		 1231 aa  431  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0671  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  44.67 
 
 		 499 aa  430  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04080  DNA-directed RNA polymerase i polypeptide 2, putative  30.17 
 
 		 1193 aa  427  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0866247  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3694  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  47.02 
 
 		 531 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1179  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  45.88 
 
 		 542 aa  426  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0027  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  46.64 
 
 		 496 aa  424  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.483388  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119522  DNA-directed RNA polymerase I polypeptide 2  29.73 
 
 		 1145 aa  415  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.050944  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0515  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  43.97 
 
 		 520 aa  416  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77977  DNA-directed RNA polymerase I  30.29 
 
 		 1167 aa  416  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.481222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0107  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  43.71 
 
 		 521 aa  410  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.397905  normal  0.532786 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1163  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  41.13 
 
 		 516 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.552918 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9235  predicted protein  29.56 
 
 		 1147 aa  407  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0784  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  43.08 
 
 		 521 aa  406  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2150  RNA polymerase beta subunit  42.08 
 
 		 526 aa  404  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0351  RNA polymerase beta subunit  42.05 
 
 		 524 aa  405  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0312  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  41.9 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0298  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  41.9 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.992089  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2159  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  42.45 
 
 		 503 aa  395  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0050  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  42.47 
 
 		 518 aa  389  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1934  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  41.39 
 
 		 522 aa  386  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0244  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  27.58 
 
 		 1217 aa  305  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29830  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.82 
 
 		 1170 aa  272  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896013 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0580  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  26.03 
 
 		 1170 aa  265  4.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0311917 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0446  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  27.52 
 
 		 1235 aa  237  8e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2719  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  37.62 
 
 		 1176 aa  228  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0312  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  36.01 
 
 		 1246 aa  224  7e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0804  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  31.18 
 
 		 1228 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0442499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0414  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  36.52 
 
 		 1115 aa  222  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0178041  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2468  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  30.54 
 
 		 1141 aa  221  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716537 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1492  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  35.38 
 
 		 1202 aa  220  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0284  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  36.12 
 
 		 1212 aa  220  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140323 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1981  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  36.36 
 
 		 1196 aa  218  4e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0160  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  36.36 
 
 		 1191 aa  218  5e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2724  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  36.25 
 
 		 1250 aa  217  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.280863  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1845  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  35.87 
 
 		 1193 aa  217  9e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0099  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  35.87 
 
 		 1190 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1532  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  35.63 
 
 		 1126 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0103  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  35.87 
 
 		 1185 aa  216  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000686573  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01090  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  36.01 
 
 		 1090 aa  215  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000929297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0859  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  35.77 
 
 		 1238 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111826  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0579  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.16 
 
 		 1183 aa  214  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0565  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.16 
 
 		 1183 aa  214  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0974  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  35.44 
 
 		 1070 aa  214  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000799261  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0183  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  29.75 
 
 		 1183 aa  214  7e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0702536  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1825  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  34.31 
 
 		 1202 aa  214  7e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0481  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  29.97 
 
 		 1152 aa  214  7.999999999999999e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1958  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  33.49 
 
 		 1173 aa  212  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2722  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  35.77 
 
 		 1234 aa  212  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.304828  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2408  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  35.77 
 
 		 1234 aa  212  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154863  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1375  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit  34.79 
 
 		 1197 aa  211  5e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2707  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  36.12 
 
 		 1227 aa  211  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.608751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0123  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.71 
 
 		 1177 aa  208  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5203  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.71 
 
 		 1177 aa  208  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000890566  unclonable  1.148e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0114  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.71 
 
 		 1130 aa  208  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.65239e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.71 
 
 		 1177 aa  208  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.907147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.71 
 
 		 1177 aa  208  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0098  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  33.71 
 
 		 1177 aa  208  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>