More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_43919 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  100 
 
 		 407 aa  839    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  36.04 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  39.69 
 
 		 344 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  39.08 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  39.38 
 
 		 342 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  37.16 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  38.44 
 
 		 347 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  38.44 
 
 		 347 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  38.44 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  38.12 
 
 		 347 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  37.5 
 
 		 346 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  37.19 
 
 		 346 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  40 
 
 		 345 aa  186  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  39.69 
 
 		 358 aa  186  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  36.88 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  38.77 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  35.94 
 
 		 343 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  36.45 
 
 		 342 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  37.16 
 
 		 344 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  37.38 
 
 		 346 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  35.36 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  35.89 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  37.46 
 
 		 344 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  34.53 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  33.98 
 
 		 345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  35.26 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  34.89 
 
 		 361 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  32.63 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  39.74 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  36.78 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  35.58 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  35.51 
 
 		 346 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  35.78 
 
 		 341 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  36.01 
 
 		 354 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  36.78 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  35 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  36.28 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  36.84 
 
 		 577 aa  163  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  36.17 
 
 		 353 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  35.08 
 
 		 357 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  34.77 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  32.01 
 
 		 341 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  33.05 
 
 		 342 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  41.26 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  32.77 
 
 		 342 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  35.71 
 
 		 578 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  30.99 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  34.3 
 
 		 582 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  30.93 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  31.95 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  32.84 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  32.52 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  32.52 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  32.52 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  32.52 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  32.21 
 
 		 340 aa  136  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  32.21 
 
 		 340 aa  136  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  32.52 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  32 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  34.42 
 
 		 341 aa  133  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  30.84 
 
 		 340 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  31.6 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  30.4 
 
 		 340 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  30.26 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  29.97 
 
 		 340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  29.97 
 
 		 340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  30.98 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  30.06 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  30.06 
 
 		 341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  30.67 
 
 		 340 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  30.67 
 
 		 340 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  30.06 
 
 		 341 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  30.87 
 
 		 340 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  30.87 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  35.27 
 
 		 340 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  38.42 
 
 		 328 aa  106  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  34.57 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  34.18 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  33.77 
 
 		 364 aa  103  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  34.51 
 
 		 344 aa  103  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  33.49 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  35.35 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  34.36 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  33.5 
 
 		 322 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  35.02 
 
 		 378 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  36.14 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  33.2 
 
 		 311 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  36.14 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  30 
 
 		 346 aa  96.7  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  31.95 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  35.2 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  35.03 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3588  histone deacetylase superfamily  31.17 
 
 		 324 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.503962  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  35.55 
 
 		 372 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3520  histone deacetylase superfamily  31.17 
 
 		 336 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0356949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  35.79 
 
 		 528 aa  93.6  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  32.77 
 
 		 322 aa  93.6  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  33.85 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  34.6 
 
 		 345 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  37.84 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>