More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_10948 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_10948  predicted protein  100 
 
 
120 aa  249  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44514  light histidine kinase  58.77 
 
 
850 aa  144  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_52311  diatom response regulator 3  53.51 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8970  predicted protein  36.97 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
877 aa  80.9  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73542  histidine kinase osmosensor  36.21 
 
 
1118 aa  77  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1305 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 
909 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
1791 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.39 
 
 
631 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03240  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.45 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604152  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.04 
 
 
763 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06820  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00660)  32.79 
 
 
1212 aa  70.5  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.557385 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0072  putative sensor/response hybrid  36.36 
 
 
527 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0111636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 
863 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  36.94 
 
 
758 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
756 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  32.2 
 
 
691 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1253  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  hitchhiker  0.000294124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3343  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
800 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.339102  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6438  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.36 
 
 
394 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00615091  normal  0.383003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  38.6 
 
 
977 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  34.21 
 
 
1193 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
1550 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4576  histidine kinase  32.48 
 
 
678 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.354871 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
717 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.9 
 
 
772 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  29.17 
 
 
1574 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
674 aa  67.4  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
1101 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
1075 aa  67.4  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
977 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
769 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.23 
 
 
1453 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02836  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R2 (raxR2)  35.14 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1977  DNA-binding response regulator  33.94 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.166768  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  30.51 
 
 
647 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.23 
 
 
957 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
764 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  30.77 
 
 
422 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
1692 aa  66.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  35.71 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  33.04 
 
 
1297 aa  65.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  38.98 
 
 
957 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 
850 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  38.98 
 
 
949 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
766 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
781 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
865 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
769 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2918  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
779 aa  65.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  32.5 
 
 
1643 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  33.64 
 
 
769 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  38.98 
 
 
949 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  33.64 
 
 
769 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12820  two-component sensor  35 
 
 
1212 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0706  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
928 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357941  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  33.64 
 
 
769 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
769 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3079  composite two component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  36.04 
 
 
994 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0449118  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1508  response regulator receiver protein  29.73 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1452  two component transcriptional regulator  29.73 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1162  two-component sensor  33.9 
 
 
1215 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
846 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1213  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64230  RetS (regulator of exopolysaccharide and Type III secretion)  33.93 
 
 
942 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0403381  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.36 
 
 
232 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
245 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  29.31 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  31.25 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
899 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.618287  normal  0.57938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
917 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
1005 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 
228 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3615  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.36 
 
 
383 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.176603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  33.91 
 
 
1135 aa  64.3  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4255  PAS/PAC sensor, hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
1418 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377123  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
1267 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  34.51 
 
 
1000 aa  64.3  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
760 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.23 
 
 
934 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  29.51 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
917 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4447  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 
1878 aa  63.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.516196  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5576  sensor/response regulator hybrid  33.93 
 
 
962 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4824  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 
923 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.688381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  33.02 
 
 
394 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0065  response regulator receiver domain-containing protein  33.93 
 
 
196 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670969  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
1316 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
1433 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  32.46 
 
 
244 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  32.46 
 
 
244 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03091  hypothetical protein  30.36 
 
 
368 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.23 
 
 
955 aa  63.5  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
936 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.36 
 
 
1499 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  32.17 
 
 
1014 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  34.48 
 
 
544 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>