More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8970 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_8970  predicted protein  100 
 
 
124 aa  255  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
674 aa  90.5  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0706  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
928 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357941  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0611  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
925 aa  87  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62789  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 
1054 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64230  RetS (regulator of exopolysaccharide and Type III secretion)  37.4 
 
 
942 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0403381  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4868  sensor histidine kinase/response regulator RetS  36.36 
 
 
929 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4408  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:histidine kinase:histidine kinase  36.36 
 
 
929 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4699  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
923 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200679  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5576  sensor/response regulator hybrid  37.4 
 
 
962 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06870  hybrid histidine protein kinase RetS  37.29 
 
 
933 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577631  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4614  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
923 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863482  normal  0.296425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4877  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
923 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.876139  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10948  predicted protein  36.97 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
1075 aa  84.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4824  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
923 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.688381 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73542  histidine kinase osmosensor  42.28 
 
 
1118 aa  82.4  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2619  histidine kinase  36.07 
 
 
667 aa  81.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.01076  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2670  histidine kinase  36.07 
 
 
667 aa  81.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.754609  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  33.06 
 
 
1574 aa  80.9  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  42.34 
 
 
1055 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1765  histidine kinase  38.02 
 
 
462 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595997  normal  0.0193451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
1313 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  36.44 
 
 
1322 aa  78.2  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
784 aa  77.8  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
893 aa  77  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2502  sensor histidine kinase/response regulator  41.32 
 
 
676 aa  77  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000989132  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06820  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00660)  31.54 
 
 
1212 aa  76.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.557385 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  40.32 
 
 
742 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.5 
 
 
763 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3355  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
685 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162851  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1092  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  39.67 
 
 
1297 aa  75.5  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
962 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
924 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  34.13 
 
 
900 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
1407 aa  74.3  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3783  histidine kinase  37.19 
 
 
737 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18481  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
1101 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
969 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  37.4 
 
 
691 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  35.48 
 
 
544 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1265  sensor histidine kinase/response regulator  37.19 
 
 
445 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  38.98 
 
 
1177 aa  73.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
1362 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
932 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0472  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
517 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
936 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
947 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0416  histidine kinase  38.74 
 
 
896 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
1691 aa  73.6  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1096 aa  72.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
1064 aa  72.8  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1665  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.88 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3839  histidine kinase  34.71 
 
 
590 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
835 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_52311  diatom response regulator 3  36.13 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 
927 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
1363 aa  72  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  35.25 
 
 
787 aa  72  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1229 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  38.66 
 
 
751 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44514  light histidine kinase  33.9 
 
 
850 aa  72  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1266 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 
724 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 
718 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
1120 aa  72  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
1027 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  34.43 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.36 
 
 
1053 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
859 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
899 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  38.33 
 
 
772 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
1260 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4574  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
729 aa  71.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.543152  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0588  ATP-binding region ATPase domain protein  34.51 
 
 
1068 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
846 aa  71.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.77 
 
 
620 aa  70.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  36.04 
 
 
676 aa  70.9  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 
721 aa  70.9  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.06 
 
 
1442 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  33.93 
 
 
797 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1596 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  35.09 
 
 
1885 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
1182 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.77 
 
 
2213 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  37.5 
 
 
942 aa  70.5  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
1199 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
945 aa  70.5  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
524 aa  69.3  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
1029 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  37.5 
 
 
735 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
843 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1147  response regulator receiver protein  47.06 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  38.05 
 
 
564 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
1313 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0522  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 
1124 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25170  hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
642 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>