More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_10722 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_10722  predicted protein  100 
 
 
153 aa  303  7e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3227  predicted protein  42.24 
 
 
416 aa  100  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0464388  normal  0.134886 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1961  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.36 
 
 
389 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1940  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.36 
 
 
389 aa  99.4  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.218077  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1916  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.36 
 
 
389 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2119  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.36 
 
 
389 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00322854  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2109  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.36 
 
 
389 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2143  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.36 
 
 
389 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.36 
 
 
389 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000776254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2189  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.91 
 
 
389 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000387501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.71 
 
 
389 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000478043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3195  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.36 
 
 
389 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.262008  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.06 
 
 
389 aa  98.2  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361676  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3711  putative ATP-dependent RNA helicase  36.84 
 
 
436 aa  98.2  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132588  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4297  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.35 
 
 
442 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.26 
 
 
417 aa  96.7  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0558  ATP-dependent RNA helicase SrmB  37.42 
 
 
416 aa  95.5  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001255  ATP-dependent RNA helicase  35.29 
 
 
443 aa  95.5  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7264  DEAD/DEAH box helicase  39.35 
 
 
481 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.25 
 
 
465 aa  94.7  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.509668  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4664  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  38.06 
 
 
442 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1584  superfamily II DNA/RNA helicase  36.67 
 
 
454 aa  94  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11921  putative ATP-dependent RNA helicase  36.36 
 
 
595 aa  93.6  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.412089  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1273  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.6 
 
 
456 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163925 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5967  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.71 
 
 
477 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7154  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.06 
 
 
479 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.557352 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6264  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.71 
 
 
511 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05125  ATP-dependent RNA helicase  35.29 
 
 
447 aa  92.8  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3036  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  37.42 
 
 
453 aa  92.8  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2606  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.25 
 
 
449 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.581519  hitchhiker  0.0000000487661 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2444  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.25 
 
 
449 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000483539 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2514  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.25 
 
 
449 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2698  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.6 
 
 
451 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  hitchhiker  0.0000852127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2838  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.6 
 
 
449 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1660  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.6 
 
 
451 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1820  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  35.71 
 
 
447 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1645  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.6 
 
 
451 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1768  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.42 
 
 
405 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1497  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.42 
 
 
405 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.333515  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1682  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.6 
 
 
451 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.747215  normal  0.719236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2624  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.29 
 
 
448 aa  90.9  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.394652  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4569  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.71 
 
 
483 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0474956 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.71 
 
 
507 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.110628 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5193  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.06 
 
 
481 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0459636 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5192  DEAD/DEAH box helicase-like  38.71 
 
 
507 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3053  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.6 
 
 
447 aa  90.5  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.643926  normal  0.011472 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1537  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.95 
 
 
449 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.713304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4766  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.36 
 
 
443 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110868  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_002978  WD1236  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.79 
 
 
408 aa  89  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1112  DEAD/DEAH box helicase-like  36.6 
 
 
593 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.446454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2189  putative ATP-dependent RNA helicase, rhlE  37.42 
 
 
523 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4920  DEAD/DEAH box helicase-like  36.77 
 
 
446 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126468  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0299  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.5 
 
 
364 aa  88.6  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265949  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1158  ATP-dependent RNA helicase  36.77 
 
 
447 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413431  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1417  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.95 
 
 
468 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0306268  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0882  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  38.89 
 
 
439 aa  88.2  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.18261  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0657  ATP-dependent RNA helicase  35.95 
 
 
450 aa  87.8  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12760  ATP-dependent RNA helicase  37.42 
 
 
449 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00382469  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1239  superfamily II DNA/RNA helicase  35.14 
 
 
360 aa  88.2  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.604047  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0076  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.29 
 
 
452 aa  87.8  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000113664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3215  putative ATP-dependent RNA helicase SrmB  32.48 
 
 
448 aa  87.8  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.571925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.71 
 
 
443 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00424195  normal  0.0145877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.71 
 
 
443 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00319736  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2445  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.6 
 
 
451 aa  87.8  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.959093  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.84 
 
 
453 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512002  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4532  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.84 
 
 
440 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4097  ATP-dependent RNA helicase SrmB  38.06 
 
 
417 aa  87.4  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.872576  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0802  ATP-dependent RNA helicase SrmB  35.48 
 
 
411 aa  87.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0462  superfamily II DNA/RNA helicase  35.33 
 
 
446 aa  87.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0709  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.54 
 
 
422 aa  87  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05150  conserved hypothetical protein  35.95 
 
 
606 aa  87  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19120  ATP-dependent DEAD/DEAH box helicase  38.82 
 
 
439 aa  87  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1688  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.76 
 
 
509 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.279594  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1017  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.22 
 
 
535 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0654  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.06 
 
 
439 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000031459  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47365  predicted protein  37.74 
 
 
603 aa  86.3  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.776919  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1618  DEAD/DEAH box helicase-like  35.1 
 
 
447 aa  86.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.64 
 
 
460 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000327397 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01939  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  34.51 
 
 
441 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0271466  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2139  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.22 
 
 
464 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004445  ATP-dependent RNA helicase SrmB  33.55 
 
 
407 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0454053  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0191  ATP-dependent RNA helicase SrmB  33.97 
 
 
423 aa  85.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1185  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.09 
 
 
414 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.505533 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00952  ATP-dependent RNA helicase SrmB  33.55 
 
 
407 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1664  superfamily II DNA/RNA helicase  35.33 
 
 
447 aa  85.5  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0767  ATP-dependent RNA helicase SrmB  38.06 
 
 
419 aa  85.5  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0735156 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.37 
 
 
448 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00759671  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0289  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.97 
 
 
447 aa  85.1  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0890  ATP-dependent RNA helicase SrmB  33.97 
 
 
408 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0724766 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0291  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.11 
 
 
577 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.279788 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46542  predicted protein  36.3 
 
 
545 aa  85.1  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.893722  normal  0.156385 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3284  ATP-dependent RNA helicase SrmB  35.48 
 
 
412 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.35 
 
 
423 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01949  ATP-dependent RNA helicase has1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBY1]  38.82 
 
 
609 aa  84.7  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.429941  normal  0.205998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.42 
 
 
599 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.18 
 
 
480 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81459  RNA-dependent helicase  38.16 
 
 
567 aa  84.3  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_004310  BR1052  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.58 
 
 
535 aa  84.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.6 
 
 
623 aa  84  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3728  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.19 
 
 
447 aa  84  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201471  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>