More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1664 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0289  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  89.49 
 
 
447 aa  790    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0462  superfamily II DNA/RNA helicase  67.56 
 
 
446 aa  642    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1664  superfamily II DNA/RNA helicase  100 
 
 
447 aa  915    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1584  superfamily II DNA/RNA helicase  58.47 
 
 
454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0532  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.43 
 
 
457 aa  498  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000013881  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1285  superfamily II DNA/RNA helicase  53.57 
 
 
454 aa  491  1e-137  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2407  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.75 
 
 
435 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.74616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.35 
 
 
436 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3013  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.53 
 
 
436 aa  421  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4366  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.72 
 
 
436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000110703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4187  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.72 
 
 
436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4025  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.72 
 
 
436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4035  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.72 
 
 
436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000492575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4419  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  54.72 
 
 
436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000144636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4307  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  54.72 
 
 
436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.163670000000001e-32 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.72 
 
 
436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000163692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0833  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  54.44 
 
 
436 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  hitchhiker  0.0000000000789178 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4403  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  54.44 
 
 
436 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000107871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.97 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000176231  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.99 
 
 
448 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0163968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1616  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.99 
 
 
448 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.309346  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.44 
 
 
448 aa  368  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000682714  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0420  superfamily II DNA/RNA helicase  45.23 
 
 
464 aa  359  6e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl273  ATP-dependent RNA helicase  38.02 
 
 
460 aa  315  9.999999999999999e-85  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00339655  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0500  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.1 
 
 
453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0107165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2900  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  40.5 
 
 
450 aa  289  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426255  normal  0.0366346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2301  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.5 
 
 
450 aa  289  7e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2475  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.5 
 
 
450 aa  289  7e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.22 
 
 
447 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000655646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2269  ATP-dependent RNA helicase  40.22 
 
 
450 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.22 
 
 
450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000706088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2430  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  39.94 
 
 
458 aa  286  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2496  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  39.94 
 
 
450 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2223  ATP-dependent RNA helicase  39.94 
 
 
450 aa  286  7e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2571  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  39.39 
 
 
454 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.39 
 
 
539 aa  276  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.27 
 
 
532 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0686  ATP-dependent RNA helicase  34.76 
 
 
445 aa  268  2e-70  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0037  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.34 
 
 
460 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  36.44 
 
 
528 aa  263  4e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  38.06 
 
 
485 aa  262  1e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.64 
 
 
434 aa  260  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3324  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.7 
 
 
446 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.15 
 
 
481 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.21 
 
 
405 aa  256  5e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0642  DEAD/DEAH box helicase-like  39.38 
 
 
513 aa  256  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.770015  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.6 
 
 
482 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.11 
 
 
498 aa  255  9e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.47 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.65 
 
 
532 aa  254  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.47 
 
 
511 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1643  superfamily II DNA/RNA helicase  36.67 
 
 
521 aa  254  3e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.65 
 
 
565 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.47 
 
 
525 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.47 
 
 
525 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  35.47 
 
 
528 aa  253  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  35.47 
 
 
533 aa  253  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.47 
 
 
528 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  35.47 
 
 
528 aa  252  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.47 
 
 
528 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.47 
 
 
528 aa  252  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  36.57 
 
 
527 aa  252  8.000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.15 
 
 
541 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1225  DEAD/DEAH box helicase  37.43 
 
 
628 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.75882  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  36.19 
 
 
530 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  37.22 
 
 
551 aa  251  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2544  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.41 
 
 
680 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.711022  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2640  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.43 
 
 
651 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2294  hypothetical protein  35.47 
 
 
589 aa  251  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2267  hypothetical protein  35.47 
 
 
589 aa  251  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2734  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.43 
 
 
652 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  35.2 
 
 
529 aa  250  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  34.36 
 
 
656 aa  249  5e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.95 
 
 
533 aa  249  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.57 
 
 
528 aa  249  7e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.2 
 
 
538 aa  249  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1688  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.99 
 
 
509 aa  247  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.279594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.64 
 
 
466 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.77 
 
 
584 aa  245  9e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1307  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.43 
 
 
657 aa  245  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.396333 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.02 
 
 
599 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  37.12 
 
 
590 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1816  DEAD/DEAH box helicase-like  34.64 
 
 
531 aa  243  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2800  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.06 
 
 
505 aa  243  7e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0442  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.57 
 
 
513 aa  243  7e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.5 
 
 
514 aa  242  9e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2118  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.15 
 
 
506 aa  242  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000739492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.15 
 
 
506 aa  242  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000532471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.11 
 
 
530 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3732  DEAD/DEAH box helicase-like  36.41 
 
 
495 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.92 
 
 
527 aa  241  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.8 
 
 
611 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.31 
 
 
542 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0042601  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0430  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.44 
 
 
663 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0524797  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.93 
 
 
607 aa  238  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.017054  normal  0.720031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4475  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.46 
 
 
457 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.75 
 
 
595 aa  239  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0439  cold-shock DEAD box protein A (ATP-independent RNA helicase)  35 
 
 
641 aa  237  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.251569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.54 
 
 
527 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.72 
 
 
550 aa  237  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>