More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0538 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 462 aa  953    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  27.92 
 
 		 470 aa  149  9e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  26.29 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  25.31 
 
 		 462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 483 aa  139  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 463 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  25.51 
 
 		 463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 496 aa  129  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 		 453 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  25.18 
 
 		 443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  26.11 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  24.88 
 
 		 491 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 		 448 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  23.21 
 
 		 451 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  22.9 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  27.65 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 460 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 		 455 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  23.03 
 
 		 451 aa  96.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 419 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 1496 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  22.63 
 
 		 449 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  22.06 
 
 		 441 aa  94  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 454 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 448 aa  90.1  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 442 aa  90.1  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 		 443 aa  87  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.75 
 
 		 419 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.1 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3983  outer membrane efflux protein  21.06 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  22.48 
 
 		 480 aa  76.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  21.49 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1581  outer membrane efflux protein  21.56 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 421 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  23.01 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.74 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  19.71 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  19.78 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.75 
 
 		 546 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.13 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.82 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  24.56 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  26.73 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.92 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.3 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  21.43 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  24.04 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  22.66 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  22.07 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1951  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.94 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.05 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  21.96 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  22.43 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  22.33 
 
 		 1470 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  22.45 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  23.35 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  21.96 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  22.48 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.02 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  21.82 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.82 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4223  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.12 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00337155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.12 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.0805194 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  20.87 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.45 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  23.8 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  23.35 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  19.47 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.76 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  20.15 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  20.68 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  20.87 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  19.34 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1841  Outer membrane protein-like protein  21.89 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  21.38 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.18 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.8 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  20.79 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.6 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.07 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  23.91 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3836  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.77 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  22.68 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  22.47 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>