More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3394 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  100 
 
 		 198 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  99.49 
 
 		 198 aa  384  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  55.81 
 
 		 515 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  35.75 
 
 		 303 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  38.64 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  36.87 
 
 		 569 aa  92.4  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  33.17 
 
 		 356 aa  89.4  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  34.64 
 
 		 327 aa  88.6  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  35.2 
 
 		 219 aa  85.5  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  32.64 
 
 		 292 aa  84.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  33.54 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  48.42 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  32.32 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  32.12 
 
 		 358 aa  82  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  32.34 
 
 		 342 aa  82  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  33.16 
 
 		 486 aa  81.3  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  32.81 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  32.34 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  33.83 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  33.16 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  31.25 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  35.35 
 
 		 287 aa  78.6  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  32.65 
 
 		 365 aa  77.8  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  39.23 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  38.57 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  35.26 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  30.36 
 
 		 669 aa  76.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  31.91 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  31.91 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  32.11 
 
 		 396 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  34.48 
 
 		 386 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  31.52 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  36.05 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  38.1 
 
 		 389 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  30.53 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  30.27 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  41.84 
 
 		 625 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.84 
 
 		 625 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  28.57 
 
 		 286 aa  75.1  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  41.84 
 
 		 625 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  30.65 
 
 		 279 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  39.55 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  35.66 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  29.29 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  33.67 
 
 		 554 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  40.82 
 
 		 625 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  35.08 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  36.36 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  37.76 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  36.92 
 
 		 519 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  36.36 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  36.36 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  35.66 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  35.66 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  35.1 
 
 		 513 aa  71.6  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  30.29 
 
 		 274 aa  71.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  34.69 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  31.13 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  30.54 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2486  Rhomboid family protein  31.49 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19288  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  31.54 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  36.5 
 
 		 511 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  38.54 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  34.13 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  40 
 
 		 362 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  33.77 
 
 		 283 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  34.88 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  34.73 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  38.78 
 
 		 625 aa  67  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  32.74 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  32.65 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  33.09 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  30.41 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  31.21 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  42.55 
 
 		 523 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  30.41 
 
 		 289 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  29.9 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  30.41 
 
 		 289 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  29.7 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  42.27 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  26.18 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0605  hypothetical protein  32.43 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00675072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  30.47 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  35.46 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  36.36 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  32.87 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  28.26 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  35.38 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  33.08 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5543  predicted protein  32.64 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0202221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  44.57 
 
 		 281 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  34.62 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  36.67 
 
 		 306 aa  64.7  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  34.23 
 
 		 747 aa  64.7  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  42.55 
 
 		 528 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0287  hypothetical protein  38.54 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.742971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  40 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  41.49 
 
 		 525 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>