More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4182 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  68.89 
 
 
668 aa  927    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  66.13 
 
 
670 aa  913    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2071  ATPase  64.05 
 
 
666 aa  884    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  66.32 
 
 
670 aa  935    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1610  type II secretion system protein E  76.89 
 
 
673 aa  1079    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1748  type II secretion system protein E  55.98 
 
 
723 aa  803    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1636  type II secretion system protein E  76.89 
 
 
673 aa  1078    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4182  type II secretion system protein E  100 
 
 
676 aa  1386    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00191  general secretion pathway protein E  63.89 
 
 
638 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2264  type II secretion system protein E  47.88 
 
 
769 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  40.58 
 
 
568 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1189  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like  49.65 
 
 
594 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1299  General secretory system II protein E domain protein  36.5 
 
 
747 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1268  General secretory system II protein E domain protein  35.84 
 
 
747 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  39.84 
 
 
568 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.14 
 
 
568 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06911  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like protein  48.73 
 
 
568 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.33 
 
 
563 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.39 
 
 
571 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  39.07 
 
 
787 aa  411  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.76 
 
 
568 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  38.82 
 
 
871 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.17 
 
 
568 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  41.92 
 
 
563 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  38.96 
 
 
566 aa  405  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  38.75 
 
 
568 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  40.2 
 
 
553 aa  404  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.97 
 
 
568 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  38.52 
 
 
568 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  38.31 
 
 
558 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.59 
 
 
568 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  39.94 
 
 
571 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.59 
 
 
568 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.63 
 
 
568 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.4 
 
 
568 aa  399  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  40.67 
 
 
577 aa  397  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  39.26 
 
 
885 aa  394  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  38.36 
 
 
557 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  38.03 
 
 
570 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  38.24 
 
 
556 aa  392  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  37.56 
 
 
553 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.1 
 
 
571 aa  385  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  38.06 
 
 
558 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  39.24 
 
 
612 aa  385  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.08 
 
 
569 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  39.44 
 
 
559 aa  381  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  37.64 
 
 
561 aa  382  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  37.56 
 
 
573 aa  382  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  38.37 
 
 
567 aa  382  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  37.09 
 
 
561 aa  382  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  37.92 
 
 
610 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  38.21 
 
 
888 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.14 
 
 
569 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  43.1 
 
 
568 aa  379  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  38.7 
 
 
891 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  37.3 
 
 
557 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.48 
 
 
568 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.98 
 
 
549 aa  379  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  37.12 
 
 
571 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  38.13 
 
 
561 aa  375  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.48 
 
 
569 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  38.72 
 
 
577 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  37.1 
 
 
561 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  41.86 
 
 
501 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  37.76 
 
 
603 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  37.61 
 
 
570 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.51 
 
 
569 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  38.34 
 
 
599 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  36.15 
 
 
570 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.8 
 
 
572 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  42.45 
 
 
500 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.83 
 
 
578 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  37.18 
 
 
561 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  46.99 
 
 
727 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  45.9 
 
 
499 aa  369  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  36.11 
 
 
560 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.68 
 
 
562 aa  369  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.85 
 
 
569 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  37.81 
 
 
552 aa  369  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  47.37 
 
 
567 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  35.91 
 
 
577 aa  365  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  37.64 
 
 
599 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.11 
 
 
569 aa  365  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  40.57 
 
 
599 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  36.03 
 
 
558 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  36.03 
 
 
573 aa  365  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  36.38 
 
 
569 aa  365  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  37.28 
 
 
554 aa  365  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  38.47 
 
 
553 aa  364  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  45.52 
 
 
585 aa  363  4e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  33.82 
 
 
564 aa  363  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58750  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  40.57 
 
 
567 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.497058 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  43.87 
 
 
560 aa  363  5.0000000000000005e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  36.93 
 
 
569 aa  363  6e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.29 
 
 
570 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  36.6 
 
 
568 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  47.79 
 
 
518 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.59 
 
 
570 aa  363  8e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  46.33 
 
 
520 aa  362  9e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  37.44 
 
 
591 aa  362  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>