284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2593 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  66.53 
 
 		 492 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  66.37 
 
 		 469 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  74.74 
 
 		 489 aa  759    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 493 aa  1019    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  74.74 
 
 		 489 aa  756    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  41.63 
 
 		 706 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  34.56 
 
 		 744 aa  266  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  32.53 
 
 		 707 aa  242  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  35.31 
 
 		 715 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  33.47 
 
 		 696 aa  219  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  30.63 
 
 		 698 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  35.45 
 
 		 706 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  31.93 
 
 		 732 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  28.44 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  26.77 
 
 		 385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  28.57 
 
 		 451 aa  123  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  26.94 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  27.89 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  28.33 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4050  type III restriction protein res subunit  35.56 
 
 		 453 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0396258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  28.47 
 
 		 531 aa  110  9.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  26.98 
 
 		 654 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  26.3 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  24.94 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  25.06 
 
 		 652 aa  101  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  29.54 
 
 		 443 aa  100  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  27.17 
 
 		 470 aa  100  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  24.89 
 
 		 449 aa  99  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  25.37 
 
 		 499 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  24.71 
 
 		 479 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  28.11 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  28.16 
 
 		 517 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  25.37 
 
 		 466 aa  90.9  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  26.89 
 
 		 444 aa  90.1  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  26.92 
 
 		 479 aa  89.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  25.89 
 
 		 494 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  26.03 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.2 
 
 		 633 aa  88.6  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  25.79 
 
 		 468 aa  87  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  28.26 
 
 		 451 aa  87  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  25.37 
 
 		 590 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  25.64 
 
 		 531 aa  85.9  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  27.94 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  26.28 
 
 		 647 aa  83.6  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  24 
 
 		 630 aa  80.9  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  27.05 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  25.78 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  24.88 
 
 		 586 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  23.56 
 
 		 574 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 		 666 aa  77.4  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  24.48 
 
 		 577 aa  76.6  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  24.37 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  24.08 
 
 		 565 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  24.37 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  23.36 
 
 		 566 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  24.55 
 
 		 590 aa  73.6  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  23.59 
 
 		 951 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  22.69 
 
 		 574 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  24.32 
 
 		 560 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  24.32 
 
 		 560 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  24.32 
 
 		 560 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  24.19 
 
 		 582 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  23.56 
 
 		 563 aa  71.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  26.08 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  41.56 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  26.98 
 
 		 1033 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  26.67 
 
 		 1033 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  25.2 
 
 		 649 aa  69.7  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  23.81 
 
 		 1029 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 593 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  24.51 
 
 		 643 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  23.92 
 
 		 569 aa  68.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0355  type III restriction enzyme, res subunit  22.44 
 
 		 596 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.098863  normal  0.390536 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  27.66 
 
 		 886 aa  68.2  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  23 
 
 		 592 aa  68.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  24.49 
 
 		 575 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  24.47 
 
 		 905 aa  67.4  0.0000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  24.37 
 
 		 658 aa  67.4  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  24.67 
 
 		 1065 aa  67  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  24.66 
 
 		 626 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.27 
 
 		 589 aa  65.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.1 
 
 		 593 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  25.78 
 
 		 1043 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  27.16 
 
 		 550 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  22.86 
 
 		 595 aa  64.3  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  26.32 
 
 		 949 aa  63.9  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  25.08 
 
 		 949 aa  63.5  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  22.39 
 
 		 599 aa  63.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.89 
 
 		 606 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  27.34 
 
 		 561 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  22.49 
 
 		 1051 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  23.22 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  24.04 
 
 		 622 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  25.63 
 
 		 549 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 1066 aa  61.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  24.14 
 
 		 813 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  24.53 
 
 		 549 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  23.87 
 
 		 1028 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  23.75 
 
 		 1348 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  23.49 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>