55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0355 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0355  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 596 aa  1223    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.098863  normal  0.390536 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  25 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  25.89 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  22.99 
 
 		 469 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  22.44 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  23.34 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  21.94 
 
 		 732 aa  64.3  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  25.16 
 
 		 696 aa  63.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  24.5 
 
 		 698 aa  63.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  22.68 
 
 		 951 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  23.19 
 
 		 707 aa  62.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  21.01 
 
 		 489 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  23.19 
 
 		 715 aa  61.6  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  22.31 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  22.2 
 
 		 744 aa  60.8  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  21.01 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  21.28 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  21.95 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  22.09 
 
 		 443 aa  56.6  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  22.96 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  22.59 
 
 		 531 aa  55.5  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  22.65 
 
 		 466 aa  55.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  21.98 
 
 		 440 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  23.94 
 
 		 509 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  19.66 
 
 		 451 aa  53.5  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  23.94 
 
 		 509 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  22.09 
 
 		 590 aa  53.9  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  22.42 
 
 		 551 aa  53.5  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  21.95 
 
 		 479 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  23.04 
 
 		 1108 aa  51.2  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  28.12 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  20.59 
 
 		 491 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  20.39 
 
 		 706 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  20.42 
 
 		 654 aa  49.7  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  19.67 
 
 		 531 aa  49.7  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  30.71 
 
 		 462 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1523  DEAD/DEAH box helicase-like  21.25 
 
 		 936 aa  48.9  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  21.99 
 
 		 652 aa  48.5  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  27.34 
 
 		 449 aa  48.5  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  22.8 
 
 		 565 aa  48.5  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 444 aa  47.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  28.24 
 
 		 778 aa  47.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10557  ATP-dependent RNA helicase ded1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C2M6]  24.44 
 
 		 668 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.645505 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  20.1 
 
 		 650 aa  47  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55603  ATP-dependent RNA helicase of DEAD box family  26.28 
 
 		 616 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3202  type III restriction protein res subunit  22.99 
 
 		 1133 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  33.85 
 
 		 466 aa  45.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  25 
 
 		 484 aa  44.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  32.81 
 
 		 451 aa  44.3  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  20.75 
 
 		 574 aa  44.3  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  26.06 
 
 		 455 aa  44.3  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  20.52 
 
 		 905 aa  44.3  0.007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  20.38 
 
 		 494 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0135  excinuclease ABC subunit B  29.52 
 
 		 666 aa  43.9  0.009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  42.86 
 
 		 1113 aa  43.9  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>