More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47380 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  97.06 
 
 
851 aa  1656    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  45.27 
 
 
849 aa  711    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  100 
 
 
851 aa  1751    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2862  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.61 
 
 
737 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0664764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1420  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.93 
 
 
739 aa  330  7e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330075  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  30.61 
 
 
737 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1308  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.65 
 
 
737 aa  327  8.000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2957  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.79 
 
 
739 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1397  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.65 
 
 
739 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1381  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.65 
 
 
739 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  31.38 
 
 
744 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  29.28 
 
 
730 aa  240  9e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0728  hemin receptor, outer membrane protein  43.12 
 
 
314 aa  230  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.5 
 
 
676 aa  192  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.44 
 
 
681 aa  184  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.39 
 
 
690 aa  172  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.1 
 
 
704 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.13 
 
 
688 aa  160  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.18 
 
 
861 aa  160  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.09 
 
 
697 aa  157  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.35 
 
 
862 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.83 
 
 
867 aa  151  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.96 
 
 
862 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.1 
 
 
862 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 
649 aa  144  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.15 
 
 
689 aa  143  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.93 
 
 
696 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.13 
 
 
696 aa  141  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.96 
 
 
859 aa  141  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.43 
 
 
717 aa  141  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.75 
 
 
677 aa  140  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  26.99 
 
 
800 aa  139  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.33 
 
 
685 aa  139  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.45 
 
 
722 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.99 
 
 
696 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2389  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 
823 aa  132  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.687523  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.86 
 
 
696 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  25.52 
 
 
857 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.43 
 
 
686 aa  129  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.16 
 
 
696 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.96 
 
 
695 aa  127  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.75 
 
 
657 aa  127  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.61 
 
 
743 aa  126  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  22.75 
 
 
660 aa  125  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  22.75 
 
 
660 aa  125  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.55 
 
 
778 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.55 
 
 
661 aa  124  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  23.51 
 
 
697 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.23 
 
 
716 aa  122  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.33 
 
 
676 aa  122  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  23.33 
 
 
676 aa  122  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  23.19 
 
 
676 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 
973 aa  120  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  23.82 
 
 
764 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.81 
 
 
759 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.56 
 
 
646 aa  114  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  23.32 
 
 
652 aa  113  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  23.89 
 
 
771 aa  112  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.92 
 
 
892 aa  111  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  25.99 
 
 
989 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  23.55 
 
 
778 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  25.1 
 
 
764 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.85 
 
 
779 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.69 
 
 
783 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  26.28 
 
 
930 aa  108  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  22.89 
 
 
693 aa  107  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.28 
 
 
892 aa  107  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  25.3 
 
 
698 aa  105  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  22.31 
 
 
668 aa  105  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0115  tonB-dependent receptor  24.48 
 
 
753 aa  104  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.92 
 
 
694 aa  104  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.05 
 
 
694 aa  103  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  23.45 
 
 
712 aa  100  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
787 aa  99.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.5 
 
 
1186 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0347  TonB-dependent receptor, plug  22.58 
 
 
670 aa  98.6  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 
654 aa  97.1  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  24.41 
 
 
490 aa  96.3  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  23.4 
 
 
885 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  31.03 
 
 
891 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2139  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.03 
 
 
766 aa  93.6  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.28 
 
 
734 aa  92  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 
828 aa  92  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.18 
 
 
757 aa  91.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 
684 aa  90.9  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 
681 aa  90.1  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4772  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.58 
 
 
769 aa  89.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784759  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.48 
 
 
767 aa  88.2  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 
668 aa  88.2  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26.03 
 
 
755 aa  88.2  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 
982 aa  88.2  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  29.22 
 
 
300 aa  87.8  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 
1018 aa  87.4  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0347  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  25.04 
 
 
759 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2296  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 
752 aa  87  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.71 
 
 
755 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  36.05 
 
 
659 aa  87  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.71 
 
 
755 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1781  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.04 
 
 
769 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  23.09 
 
 
809 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.11228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>