66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_24401 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  100 
 
 		 436 aa  841    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  65.97 
 
 		 438 aa  502  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  62.01 
 
 		 438 aa  477  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  42.03 
 
 		 467 aa  270  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  41.08 
 
 		 467 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  37.84 
 
 		 461 aa  260  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  38.72 
 
 		 470 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  38.35 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  38.35 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  37.26 
 
 		 471 aa  232  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  36.21 
 
 		 475 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  27.78 
 
 		 781 aa  160  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  28.12 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  28.98 
 
 		 496 aa  77  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  29.52 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  27.8 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  26.52 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  28.72 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  24.58 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  28.15 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  27.37 
 
 		 754 aa  57  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  26.35 
 
 		 773 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  30.13 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  26.21 
 
 		 497 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  31.55 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  28.4 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  27.68 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  23.2 
 
 		 737 aa  53.5  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 501 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  21.17 
 
 		 404 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  21.17 
 
 		 404 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  22.35 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  20.89 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  25.94 
 
 		 930 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  27.76 
 
 		 504 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  27.43 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18371  hypothetical protein  31.21 
 
 		 443 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  25.93 
 
 		 393 aa  49.7  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  26.36 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  23.86 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  23.15 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  27.71 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  27.71 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  28.17 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  23.08 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  28.17 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  21.28 
 
 		 870 aa  47.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  26.51 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  34.45 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  25.08 
 
 		 504 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0658  O-antigen polymerase family protein  24.6 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.238334  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1310  hypothetical protein  23.37 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  29.71 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3180  O-antigen polymerase  26.38 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  31.86 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  25.29 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.285408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  27.08 
 
 		 430 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  21.87 
 
 		 461 aa  43.9  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  27.44 
 
 		 531 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  31.82 
 
 		 503 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  24.29 
 
 		 492 aa  43.9  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  34.12 
 
 		 582 aa  43.5  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2697  O-antigen polymerase  26.15 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  29.14 
 
 		 466 aa  43.1  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  31.37 
 
 		 443 aa  43.1  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>