More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2189 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 484 aa  974    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  37.2 
 
 		 432 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  36.54 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  33.12 
 
 		 445 aa  187  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  32.22 
 
 		 687 aa  180  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  35.91 
 
 		 431 aa  177  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  34.93 
 
 		 475 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 		 652 aa  169  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  33.74 
 
 		 653 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  34 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 		 415 aa  160  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  32.02 
 
 		 774 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  33.89 
 
 		 963 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  35.93 
 
 		 795 aa  139  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  33.11 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  34.89 
 
 		 1454 aa  133  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  31.23 
 
 		 324 aa  126  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  29.09 
 
 		 457 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  28.78 
 
 		 322 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  28.92 
 
 		 322 aa  123  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  28.31 
 
 		 322 aa  120  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  26.5 
 
 		 396 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  33.05 
 
 		 450 aa  118  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  27.96 
 
 		 371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  29.67 
 
 		 611 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  31.18 
 
 		 514 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  27.49 
 
 		 371 aa  113  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  31.19 
 
 		 469 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  29.06 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  28.98 
 
 		 439 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  31.5 
 
 		 534 aa  110  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  29.87 
 
 		 1682 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  30.25 
 
 		 2122 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  26.38 
 
 		 616 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  26.4 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  30.82 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  29.04 
 
 		 1812 aa  102  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  28.12 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  31.02 
 
 		 643 aa  95.1  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  31.15 
 
 		 546 aa  92.8  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  26.6 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  28.69 
 
 		 382 aa  90.5  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  24.91 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  27.49 
 
 		 381 aa  89  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  24.53 
 
 		 384 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  28.49 
 
 		 901 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  29.41 
 
 		 349 aa  87  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  29.89 
 
 		 445 aa  86.3  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  27.82 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  28.08 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  26.56 
 
 		 619 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2197  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.43 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.763782  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  31.21 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  28.52 
 
 		 797 aa  80.5  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.57 
 
 		 402 aa  79.7  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1067 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  28.19 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.08 
 
 		 1383 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  27.31 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1293  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.83 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.664438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  27.01 
 
 		 705 aa  77.8  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  27.31 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  24.5 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  25.38 
 
 		 603 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  25.08 
 
 		 603 aa  77  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.36 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  26.36 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  35.78 
 
 		 861 aa  76.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  28.62 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  24.39 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.24 
 
 		 392 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.02 
 
 		 380 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.43 
 
 		 392 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  27.34 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.29 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.09 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  27.76 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  31.16 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  29.8 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  26.11 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.11 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  26.11 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  31.16 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.11 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.91 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  27.76 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.43 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.11 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.36 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.55 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  25.27 
 
 		 809 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.8 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  27.32 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  27.32 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.11 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  29.12 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  28.53 
 
 		 556 aa  73.6  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  23.91 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.93 
 
 		 393 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  27.81 
 
 		 381 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>