169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2587 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 
858 aa  1722  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  28.15 
 
 
750 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  29.27 
 
 
617 aa  184  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  27.99 
 
 
640 aa  183  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  27.96 
 
 
629 aa  181  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  27.96 
 
 
629 aa  181  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  27.55 
 
 
619 aa  177  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  27.62 
 
 
632 aa  167  1e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  26.72 
 
 
589 aa  159  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  25.96 
 
 
562 aa  131  5e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  25.93 
 
 
462 aa  117  1e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  31.78 
 
 
596 aa  115  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  26.2 
 
 
728 aa  115  4e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  31.58 
 
 
1088 aa  114  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  29.29 
 
 
719 aa  113  2e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  33.48 
 
 
1085 aa  111  4e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.63 
 
 
341 aa  111  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  30.03 
 
 
772 aa  109  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.80506e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  28.14 
 
 
754 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  33.02 
 
 
766 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  32.55 
 
 
755 aa  107  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  32.06 
 
 
772 aa  106  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  32.54 
 
 
779 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  32.54 
 
 
765 aa  106  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  25.27 
 
 
647 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  32.54 
 
 
542 aa  105  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  29.55 
 
 
766 aa  104  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  33.49 
 
 
760 aa  104  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  31.53 
 
 
995 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  23.53 
 
 
614 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  24.42 
 
 
465 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  30.95 
 
 
1112 aa  102  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  30.95 
 
 
1070 aa  102  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  30.95 
 
 
1070 aa  102  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  31.58 
 
 
760 aa  101  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  32.77 
 
 
531 aa  100  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  30.16 
 
 
585 aa  97.8  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  30.16 
 
 
585 aa  97.8  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  30.16 
 
 
585 aa  97.8  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.75 
 
 
1351 aa  97.8  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  31.56 
 
 
1012 aa  97.4  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  30.66 
 
 
994 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  33.48 
 
 
1266 aa  96.3  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  34.21 
 
 
347 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  22.78 
 
 
747 aa  95.9  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  31.11 
 
 
954 aa  95.5  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  28.51 
 
 
421 aa  95.1  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  27.8 
 
 
643 aa  95.1  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  25.99 
 
 
632 aa  94.4  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  30.71 
 
 
750 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.05 
 
 
348 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  25.38 
 
 
519 aa  93.2  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.05 
 
 
348 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  31.31 
 
 
322 aa  93.2  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  28.12 
 
 
417 aa  91.7  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  28.69 
 
 
1052 aa  88.2  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  26.7 
 
 
598 aa  84.3  9e-15  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  29.61 
 
 
400 aa  83.2  2e-14  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  25.58 
 
 
671 aa  82.4  3e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  25.73 
 
 
541 aa  81.6  6e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  23.26 
 
 
442 aa  81.3  7e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  28.15 
 
 
1011 aa  81.3  7e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  28.7 
 
 
789 aa  80.9  9e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  28.7 
 
 
789 aa  80.9  9e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  24.02 
 
 
631 aa  79.7  2e-13  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  31.3 
 
 
498 aa  78.6  5e-13  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  2.66916e-07 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  29.81 
 
 
397 aa  78.6  5e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  34.21 
 
 
587 aa  78.2  6e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  25.84 
 
 
403 aa  78.2  7e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  28.12 
 
 
404 aa  77.4  1e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.13 
 
 
1107 aa  77.4  1e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  25.15 
 
 
660 aa  77  2e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  29.95 
 
 
284 aa  76.6  2e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  30.25 
 
 
467 aa  76.6  2e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  29.03 
 
 
400 aa  75.5  4e-12  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  35.71 
 
 
590 aa  75.5  4e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  31.47 
 
 
692 aa  73.6  1e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  24.59 
 
 
477 aa  73.9  1e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  29.22 
 
 
467 aa  73.6  2e-11  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  32.43 
 
 
399 aa  73.6  2e-11  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  26.89 
 
 
993 aa  72.4  4e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  28.92 
 
 
355 aa  72  4e-11  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  25.66 
 
 
423 aa  71.6  6e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  30.43 
 
 
302 aa  68.6  5e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  28 
 
 
399 aa  68.6  6e-10  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  35.88 
 
 
877 aa  67.8  8e-10  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  28.57 
 
 
405 aa  66.6  2e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  27.34 
 
 
700 aa  66.6  2e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  23.24 
 
 
581 aa  65.9  3e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  27.67 
 
 
585 aa  65.1  5e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  28.84 
 
 
399 aa  64.3  1e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  22.05 
 
 
651 aa  63.9  1e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  25.48 
 
 
344 aa  62.8  3e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  6.48259e-05 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  25.3 
 
 
482 aa  60.8  1e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  29.03 
 
 
312 aa  60.1  2e-07  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  26.21 
 
 
379 aa  60.1  2e-07  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  31.82 
 
 
356 aa  59.7  2e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  27.2 
 
 
718 aa  60.1  2e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  21.52 
 
 
557 aa  59.3  3e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  27.81 
 
 
270 aa  58.2  6e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>