More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1641 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  100 
 
 
267 aa  533  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.58 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0291  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
227 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.45 
 
 
227 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0629  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.56 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.14 
 
 
231 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0244  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.95 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.82 
 
 
243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.28 
 
 
224 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
254 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.02 
 
 
225 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
225 aa  105  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  30.45 
 
 
225 aa  104  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1896  cyclic nucleotide-binding protein  32.26 
 
 
218 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  30.35 
 
 
224 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29 
 
 
234 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
226 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2833  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.68 
 
 
213 aa  102  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0320601  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.38 
 
 
225 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.49 
 
 
226 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
234 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1275  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
230 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1045  Crp-like transcriptional regulator  31.34 
 
 
229 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
230 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  31.28 
 
 
226 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.83 
 
 
229 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
230 aa  99.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.81 
 
 
220 aa  99.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
227 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
249 aa  99.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  29.72 
 
 
225 aa  99  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.33 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.64 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.22 
 
 
225 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
234 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
261 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.91 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0884  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.87 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163926  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
247 aa  95.9  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.36 
 
 
228 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.27 
 
 
231 aa  95.9  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.7 
 
 
225 aa  95.9  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.22 
 
 
226 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.49 
 
 
225 aa  95.5  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1234  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
232 aa  95.5  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  30.41 
 
 
225 aa  95.5  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.22 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.02 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.11 
 
 
226 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.33 
 
 
226 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3679  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
216 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.170413  normal  0.193267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  30.66 
 
 
225 aa  94.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
217 aa  93.6  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
225 aa  93.6  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.47 
 
 
223 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.68 
 
 
224 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4027  cyclic nucleotide-binding protein  31.22 
 
 
216 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.357709  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
232 aa  93.2  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  26.07 
 
 
221 aa  92.8  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
226 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.76 
 
 
219 aa  92.4  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1332  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
238 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.46 
 
 
227 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.22 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
222 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.45 
 
 
227 aa  90.1  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.25 
 
 
231 aa  90.1  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
224 aa  89.7  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
235 aa  89.7  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  28.77 
 
 
224 aa  89.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.88 
 
 
251 aa  89.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.01 
 
 
236 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.75 
 
 
224 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.57 
 
 
232 aa  88.6  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.9 
 
 
230 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.49 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.31 
 
 
224 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.04 
 
 
352 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.7 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
241 aa  86.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.99 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.88 
 
 
229 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
239 aa  86.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3643  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
221 aa  86.3  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.621489  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.96 
 
 
228 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.96 
 
 
226 aa  86.7  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.52 
 
 
228 aa  86.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.83 
 
 
228 aa  85.9  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
236 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
224 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
250 aa  85.9  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
224 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
224 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.34 
 
 
236 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
224 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.29 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>