179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1479 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1479  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  830    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000468509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  36.7 
 
 		 429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  37.05 
 
 		 466 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  36.95 
 
 		 467 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  34.68 
 
 		 459 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  36.45 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  32.95 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  41.52 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  30.86 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  30.09 
 
 		 435 aa  116  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  31.44 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  26.05 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  29.63 
 
 		 449 aa  99.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  33.07 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  32.05 
 
 		 408 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  32.05 
 
 		 408 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  32.32 
 
 		 408 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  34.96 
 
 		 455 aa  91.3  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  28.96 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  30.68 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  30.17 
 
 		 641 aa  66.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  32.06 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  22.9 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  25.31 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  29.1 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  28.78 
 
 		 300 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  31.75 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  29.83 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  33.86 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  31.37 
 
 		 575 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  26.94 
 
 		 528 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  36.89 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  29.6 
 
 		 430 aa  57  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  29.25 
 
 		 638 aa  56.6  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  33.47 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  29.58 
 
 		 288 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  38.83 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  33.73 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  27.91 
 
 		 283 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  27.95 
 
 		 451 aa  54.7  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  27.1 
 
 		 458 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  27.31 
 
 		 684 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  28.1 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  30.65 
 
 		 340 aa  53.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  36.67 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1691  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.425885  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  34.9 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  29.01 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  21.81 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  33.06 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  35 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  30.29 
 
 		 454 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  33 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  26.87 
 
 		 294 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  31.67 
 
 		 310 aa  51.2  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  44.07 
 
 		 303 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  29.69 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  38.24 
 
 		 324 aa  50.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  21.08 
 
 		 308 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  41.38 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  38.33 
 
 		 312 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  31.64 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.85 
 
 		 296 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  33.54 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  32.99 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  38.33 
 
 		 312 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  31.58 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  29.55 
 
 		 328 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  21.62 
 
 		 293 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  26.64 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  26.49 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  32.9 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  34.55 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  32.09 
 
 		 449 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  33.85 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  28.38 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  27.68 
 
 		 296 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1209  protein of unknown function DUF58  38.68 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  34.02 
 
 		 303 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  29.94 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  23.04 
 
 		 309 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  41.18 
 
 		 320 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  22.34 
 
 		 293 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  25 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  33.05 
 
 		 449 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  21.86 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  33.05 
 
 		 449 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  31.67 
 
 		 329 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  38.71 
 
 		 324 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  39.06 
 
 		 301 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  34.02 
 
 		 303 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  24.08 
 
 		 295 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  25.64 
 
 		 298 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  26.42 
 
 		 442 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  36.07 
 
 		 302 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  36.84 
 
 		 328 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  27.27 
 
 		 384 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  33.06 
 
 		 444 aa  47.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  36.17 
 
 		 429 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>