99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1250 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  100 
 
 
239 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  53.49 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  62.11 
 
 
315 aa  126  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  56.12 
 
 
454 aa  113  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  45.45 
 
 
623 aa  105  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  57.89 
 
 
270 aa  105  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  42.19 
 
 
152 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  52.58 
 
 
358 aa  97.4  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  48.54 
 
 
539 aa  94.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  46.32 
 
 
287 aa  93.2  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  40.17 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  47.95 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  45.12 
 
 
444 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  47.37 
 
 
97 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  44.16 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  40.79 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  42.11 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  45.45 
 
 
97 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  31.86 
 
 
771 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  50.51 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  43.48 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  39.6 
 
 
114 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  45 
 
 
110 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  42.5 
 
 
136 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1142  blue (type1) copper domain-containing protein  43.48 
 
 
153 aa  61.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.036139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  41.25 
 
 
120 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  47.76 
 
 
72 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1358  beta-lactamase domain-containing protein  36.59 
 
 
479 aa  58.5  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345311 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  37.5 
 
 
114 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  37.97 
 
 
123 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  38.04 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.97 
 
 
417 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  39.47 
 
 
112 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 
301 aa  56.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  35 
 
 
113 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1161  hypothetical protein  42.62 
 
 
456 aa  55.8  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  35.48 
 
 
112 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  35.48 
 
 
112 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  43.33 
 
 
926 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  36.25 
 
 
112 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  45.31 
 
 
444 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  36.25 
 
 
110 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1542  blue (type1) copper domain-containing protein  41.38 
 
 
154 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  36.25 
 
 
113 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1015  proteinase inhibitor I1 Kazal  51.35 
 
 
343 aa  53.1  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  35 
 
 
113 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0445  proteinase inhibitor I1, Kazal  53.85 
 
 
113 aa  52  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  41.1 
 
 
192 aa  52  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  33 
 
 
2179 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  44.78 
 
 
489 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  39.73 
 
 
157 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  37.18 
 
 
85 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  30.46 
 
 
486 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  31.25 
 
 
545 aa  49.7  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0845  proteinase inhibitor I1, Kazal  46.51 
 
 
261 aa  49.3  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2504  ribonuclease  36.84 
 
 
1084 aa  49.3  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  35 
 
 
116 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0340  blue (type1) copper domain-containing protein  52.5 
 
 
130 aa  48.9  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.89 
 
 
749 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  36.36 
 
 
264 aa  48.9  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  40.51 
 
 
124 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  32.41 
 
 
2272 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03550  hypothetical protein  40 
 
 
1602 aa  47.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  37.68 
 
 
119 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  37.08 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  35.53 
 
 
119 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0533  hypothetical protein  40.91 
 
 
185 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.528363  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  50 
 
 
7149 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  38.67 
 
 
131 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  41.82 
 
 
1261 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  43.86 
 
 
484 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  40.91 
 
 
117 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1166  proteinase inhibitor I1, Kazal  41.67 
 
 
263 aa  46.2  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  30.91 
 
 
772 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  29.63 
 
 
928 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3984  blue (type 1) copper domain protein  32.2 
 
 
139 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0137128  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2374  glycosy hydrolase family protein  57.14 
 
 
535 aa  45.4  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  52.63 
 
 
613 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  31.63 
 
 
140 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  50 
 
 
525 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22510  hypothetical protein  49.09 
 
 
608 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.818778 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  29.46 
 
 
137 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  38.37 
 
 
141 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  40.68 
 
 
630 aa  44.3  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  32.84 
 
 
1281 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  43.1 
 
 
501 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  34.62 
 
 
119 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  51.72 
 
 
539 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  34.57 
 
 
112 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3976  blue (type 1) copper domain protein  36.25 
 
 
149 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  31.34 
 
 
144 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  28.57 
 
 
1888 aa  42.7  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  37.88 
 
 
173 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  35.29 
 
 
522 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0200  hypothetical protein  32.35 
 
 
201 aa  42  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  38.24 
 
 
146 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  35.06 
 
 
104 aa  42  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  33.77 
 
 
150 aa  41.6  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>