169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3983 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  57.06 
 
 		 183 aa  141  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  32.81 
 
 		 204 aa  85.5  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  23.08 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  28.4 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  19.76 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  24.85 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  20.81 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  24.85 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  30.06 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  20.71 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  24.39 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  28.12 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0966  transcriptional regulator  23.49 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  21.35 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6804  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.758559 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  22.41 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  22.94 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4326  transcriptional regulator, TetR-related family  28.45 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1114  transcriptional regulator, TetR-related family  28.45 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  29.77 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1027  transcriptional regulator, TetR-related family  27.5 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34456e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0887  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0943  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2767  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2811  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548519  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2794  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.630327  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 181 aa  48.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0844  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  40 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  36.67 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  40.74 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3306  regulatory protein TetR  32.93 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000516611  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3735  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0987  transcriptional regulator, TetR-related family  27.1 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4141  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 243 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>