211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3387 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 298 aa  570  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1540  rod shape-determining protein MreC  48.11 
 
 		 327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  44.18 
 
 		 366 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  40.34 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7284  rod shape-determining protein MreC  41.32 
 
 		 290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1212  rod shape-determining protein MreC  40.07 
 
 		 327 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5268  rod shape-determining protein MreC  41.16 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3464  rod shape-determining protein MreC  37.45 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.187709  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  53.7 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0749  rod shape-determining protein MreC  42.01 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  40.36 
 
 		 248 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0888455 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  36.43 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09210  cell shape-determining protein  34.7 
 
 		 425 aa  92.4  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.76787 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  35.07 
 
 		 273 aa  89.4  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  27.44 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  30.6 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  31.71 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  25.45 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  27.09 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  31.17 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  30.17 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  31 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  32.17 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  30.7 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  27.24 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  27.72 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  30.65 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  28.03 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  30.62 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  27.7 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  33.78 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  36.78 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  23.94 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  30.38 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  26.99 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  35 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1528  rod shape-determining protein MreC  29.97 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  28.98 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  25.96 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  22.82 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  22.82 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  27.53 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  31.65 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  29 
 
 		 257 aa  67  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1282  rod shape-determining protein MreC  36.88 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  27.76 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  27.76 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  36.18 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  27.81 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  31.5 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  28.44 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  28.43 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  28.7 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  27.68 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  26.89 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  30.24 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  27.61 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  30.24 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  31.45 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  27.11 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  28.43 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0582  rod shape-determining protein MreC  26.91 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254357  hitchhiker  0.0000000000148886 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  28.52 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  28.52 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5926  Rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  28.38 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  28.38 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  25.8 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1671  rod shape-determining protein MreC  36.25 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575744 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  28.38 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  31.56 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  27.96 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3831  rod shape-determining protein MreC  25.55 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277446  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  25.96 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  25.96 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  23.01 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  21.85 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  27.68 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  28.93 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  28.47 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  26.8 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  32.26 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  27.65 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0106  Rod shape-determining protein MreC  19.78 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  28.05 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  28.02 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>