132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0193 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 295 aa  593  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5926  Rod shape-determining protein MreC  35.89 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3831  rod shape-determining protein MreC  37.63 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277446  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  32.4 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1395  rod shape-determining protein MreC  31.99 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0343017 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  30.55 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  34.75 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  34.07 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  30.11 
 
 		 257 aa  139  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  36.21 
 
 		 278 aa  136  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0866  rod shape-determining protein MreC  26.1 
 
 		 280 aa  89.7  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  25.97 
 
 		 266 aa  89.4  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  26.92 
 
 		 280 aa  89.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1166  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 283 aa  89  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  28.28 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  27.49 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  27.35 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  27.35 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1803  rod shape-determining protein MreC  24.04 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  32.14 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  32.24 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  27.15 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  25.11 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  32.54 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  33.55 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  33.55 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  33.8 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  30.41 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  25.1 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  29.89 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  27.54 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  28.66 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  29.53 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  28.48 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  29.22 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  25.35 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  25.41 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  32.46 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  32.46 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  29.19 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  26.11 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  28.41 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  27.71 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  23.69 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  33.88 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  31.88 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  27.63 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  32.35 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  32.62 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  32.26 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  26.8 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  27.54 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  28.37 
 
 		 351 aa  53.1  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  32.21 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  25.6 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  28.99 
 
 		 274 aa  52.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  33.91 
 
 		 291 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  24.36 
 
 		 276 aa  52.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  27.45 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  23.51 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  27.45 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  23.51 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0304  rod shape-determining protein MreC  25.1 
 
 		 236 aa  52.4  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  28.29 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  27.95 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  24.75 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  26.14 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  29.61 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1693  rod shape-determining protein MreC  24.7 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0326  rod shape-determining protein MreC  24.7 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0336673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  26.8 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1671  rod shape-determining protein MreC  27.22 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575744 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  26.9 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  33.79 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  27.95 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  26.8 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  30.2 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 248 aa  49.3  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0888455 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1317  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0592341  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  27.97 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  24.38 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  27.1 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  25.58 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2603  Rod shape-determining protein MreC  28.47 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  23.26 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>