More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3003 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  100 
 
 		 309 aa  610  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  57.38 
 
 		 329 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  60.2 
 
 		 306 aa  328  8e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  50.5 
 
 		 326 aa  288  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  50.49 
 
 		 343 aa  288  8e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  52.05 
 
 		 295 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.51 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0115  ABC transporter related  52.46 
 
 		 302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.478521  normal  0.0830163 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3497  ABC transporter related protein  49.01 
 
 		 323 aa  249  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  38.51 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  39.19 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  38.51 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1906  ABC transporter related protein  45.54 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  38.51 
 
 		 300 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.59 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  49.49 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  37.88 
 
 		 300 aa  230  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  42.76 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  37.84 
 
 		 300 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  37.16 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01020  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.34 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  37.84 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  41.24 
 
 		 303 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  38.61 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 325 aa  199  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  41.95 
 
 		 299 aa  196  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  37.11 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  38.14 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  42.28 
 
 		 315 aa  188  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  43.53 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  38.1 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  38.87 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  34.92 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.78 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  46.05 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  38.05 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  36.3 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  40.07 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  31.19 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  40.44 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  30.85 
 
 		 301 aa  175  7e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  37.7 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  43.78 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  37.91 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  37.91 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  37.01 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  36.1 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  37.58 
 
 		 308 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  32.57 
 
 		 308 aa  172  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  39.43 
 
 		 317 aa  172  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  37.25 
 
 		 310 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  32.45 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  38.08 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  43.19 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.49 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  42.23 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  36.08 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  42.34 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.01 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.6 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  39.02 
 
 		 326 aa  169  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  37.42 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  37.26 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  36.21 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  46.15 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  38.8 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  30.9 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  34.45 
 
 		 283 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  41.2 
 
 		 321 aa  165  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  37.42 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  37 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.79 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  34.01 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.08 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  36.19 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.75 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  41.59 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  38.33 
 
 		 293 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  35.31 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.34 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  38.25 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  35.02 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  40.47 
 
 		 309 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.99 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  32.16 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  38.44 
 
 		 741 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  45.15 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.92 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  39.83 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5589  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.05 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  34.53 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  37.38 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>