141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2268 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 		 196 aa  387  1e-107  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  63.92 
 
 		 196 aa  261  4e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  49.47 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  45.74 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  47.12 
 
 		 203 aa  181  6e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  43.46 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  43.81 
 
 		 204 aa  174  5e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  44.5 
 
 		 203 aa  174  6e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  39.89 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  37.16 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  35.33 
 
 		 211 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  39.89 
 
 		 211 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  39.15 
 
 		 217 aa  125  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  38.62 
 
 		 225 aa  124  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  35.52 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  38.51 
 
 		 210 aa  122  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  37.3 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  38.25 
 
 		 212 aa  121  6e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  38.04 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  37.7 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  34.43 
 
 		 210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  34.41 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  34.41 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  34.41 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  36.41 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  33.87 
 
 		 219 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  34.43 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  34.62 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  33.7 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  33.52 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  33.52 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  32.24 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  32.79 
 
 		 301 aa  96.3  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  32.43 
 
 		 234 aa  95.1  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  28.81 
 
 		 206 aa  94.7  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  34.39 
 
 		 250 aa  92  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  30.88 
 
 		 296 aa  91.7  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  31.18 
 
 		 282 aa  90.5  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  31.69 
 
 		 297 aa  88.2  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  30.6 
 
 		 283 aa  88.2  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  31.64 
 
 		 243 aa  87.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.68 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  29.03 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  29.63 
 
 		 259 aa  78.2  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  27.93 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  29.63 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  29.1 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  26.02 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  31.82 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  26.88 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.55 
 
 		 243 aa  74.7  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  25.91 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  33.14 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  28.57 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  28.34 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  30.18 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  26.54 
 
 		 261 aa  71.2  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  27.87 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.34 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  27.22 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  27.66 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  27.87 
 
 		 273 aa  68.2  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  28.65 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  28.34 
 
 		 225 aa  67  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  24.23 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03493  conserved hypothetical protein  23.53 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  28.05 
 
 		 268 aa  64.7  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  26.46 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  27.65 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  27.72 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  29.15 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  28.42 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  30.72 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  26.04 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  24.52 
 
 		 242 aa  62  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  27.72 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  25 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  27.44 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  28.95 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  30.52 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  27.22 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  26.55 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  26.83 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  26.32 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  28.96 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  28.92 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  26.98 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04457  20S proteasome beta-type subunit (Eurofung)  26.63 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0477671  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  20.71 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  24.73 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12731  predicted protein  26.54 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  26.45 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  26.63 
 
 		 243 aa  53.9  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  24.19 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  22.7 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  26.2 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  27.32 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  25.43 
 
 		 272 aa  52.4  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55763  predicted protein  25.95 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  28.49 
 
 		 250 aa  52.4  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>