269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0143 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
140 aa  275  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2811  transcriptional regulator, MarR family  65.96 
 
 
141 aa  183  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2675  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
150 aa  68.6  3e-11  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1072  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 
116 aa  68.2  4e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885065  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
172 aa  64.7  4e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 
142 aa  59.7  1e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
155 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
155 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
155 aa  58.9  2e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
156 aa  58.9  2e-08  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
142 aa  58.5  3e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  42.67 
 
 
159 aa  56.2  1e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 
146 aa  56.6  1e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
160 aa  53.9  7e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  38.67 
 
 
163 aa  53.5  8e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
165 aa  52.4  2e-06  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 
157 aa  52.4  2e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
146 aa  51.6  3e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  30.4 
 
 
157 aa  51.6  3e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
138 aa  51.2  4e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
151 aa  50.8  6e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
164 aa  50.8  6e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
151 aa  50.8  6e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
151 aa  50.8  6e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  32.22 
 
 
170 aa  50.4  8e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
142 aa  49.7  1e-05  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
143 aa  49.7  1e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  40 
 
 
138 aa  49.7  1e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
168 aa  49.3  2e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
166 aa  48.9  2e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
147 aa  49.7  2e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 
156 aa  48.5  3e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  39.13 
 
 
287 aa  48.5  3e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
150 aa  48.1  4e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 
149 aa  47.8  4e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
141 aa  48.1  4e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
153 aa  47.8  5e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
152 aa  47.8  5e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 
144 aa  47.8  5e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
144 aa  47.4  6e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 
156 aa  47.4  6e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  6.24146e-07  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
154 aa  47.8  6e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  36.47 
 
 
163 aa  47.4  7e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 
156 aa  47.4  7e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
172 aa  47.4  7e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
168 aa  47.4  7e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
303 aa  47.4  7e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
142 aa  47  8e-05  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 
165 aa  47  8e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
152 aa  47  8e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 
173 aa  47  9e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 
165 aa  47  9e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  33.64 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  38.89 
 
 
177 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
143 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  30.5 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4274  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  43.08 
 
 
292 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3754  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.852787  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
175 aa  45.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1929  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0438098  normal  0.235011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 
158 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
195 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  34.88 
 
 
171 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  46.94 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 
183 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40 
 
 
305 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  44.26 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  34.21 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
177 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
173 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  34.23 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  35.56 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>