More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0922 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0922  ABC transporter related  100 
 
 
353 aa  706    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1759  ABC transporter related  93.77 
 
 
353 aa  650    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1022  ABC transporter related  92.63 
 
 
353 aa  640    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  54.67 
 
 
353 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  44.44 
 
 
348 aa  311  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1819  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  42.49 
 
 
353 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147813  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1403  ABC transporter related protein  45.74 
 
 
351 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.579406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2784  ABC-type transporter, ATPase component  39.2 
 
 
383 aa  298  9e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000307726  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  45.43 
 
 
347 aa  292  6e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0256  ABC transporter-related protein  42.77 
 
 
349 aa  287  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  39.02 
 
 
351 aa  275  8e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1980  ABC transporter related  38.51 
 
 
355 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1582  ABC transporter related  38.75 
 
 
361 aa  248  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  34.56 
 
 
355 aa  230  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  35.76 
 
 
358 aa  231  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.38 
 
 
352 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 
353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.44 
 
 
354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  35.49 
 
 
367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  36.55 
 
 
352 aa  219  7.999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1445  ABC sugar transporter, ATPase subunit  34.15 
 
 
367 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  32.5 
 
 
353 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1263  putrescine transport ATP-binding protein PotG  34.85 
 
 
381 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 
353 aa  218  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  37.2 
 
 
342 aa  216  4e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.73 
 
 
353 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0527  ABC transporter related  34.2 
 
 
348 aa  216  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  33.96 
 
 
353 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2091  ABC transporter related  34.87 
 
 
359 aa  216  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  31.74 
 
 
353 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  33.71 
 
 
345 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0164  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.98 
 
 
379 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  41.67 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  34.97 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.58 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  37.05 
 
 
363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.55 
 
 
355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  39.22 
 
 
343 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0642  ABC transporter related protein  36.92 
 
 
342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.46 
 
 
357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  36.94 
 
 
359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  35.5 
 
 
372 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.84 
 
 
368 aa  212  7e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  35.9 
 
 
363 aa  212  7.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  36.75 
 
 
366 aa  212  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.22 
 
 
353 aa  212  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  33.88 
 
 
374 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  35.2 
 
 
369 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.84 
 
 
370 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0505  ABC transporter related  40.07 
 
 
345 aa  211  1e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.940496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  32.34 
 
 
381 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  31.48 
 
 
352 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  32.92 
 
 
370 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  36.07 
 
 
363 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  40 
 
 
357 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  31.48 
 
 
352 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  34.56 
 
 
384 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  34.12 
 
 
373 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.39 
 
 
362 aa  210  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.75 
 
 
356 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  34.54 
 
 
374 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  36.3 
 
 
360 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  36.43 
 
 
363 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  34.56 
 
 
384 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.88 
 
 
365 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  34.15 
 
 
362 aa  210  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4791  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.87 
 
 
374 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  35.18 
 
 
372 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  35.92 
 
 
367 aa  209  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  35.41 
 
 
359 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  32.51 
 
 
368 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  36.7 
 
 
347 aa  209  6e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  32.51 
 
 
368 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  32.21 
 
 
339 aa  209  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  35.49 
 
 
371 aa  209  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 
353 aa  209  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.33 
 
 
366 aa  209  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.01 
 
 
380 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.48 
 
 
367 aa  209  7e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  33.86 
 
 
353 aa  209  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  36.64 
 
 
360 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  36.64 
 
 
360 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  36.49 
 
 
363 aa  208  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  33.82 
 
 
357 aa  208  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.11 
 
 
355 aa  208  9e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  36.7 
 
 
360 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  32.01 
 
 
353 aa  208  9e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  36.7 
 
 
360 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  33.15 
 
 
366 aa  208  9e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.71 
 
 
356 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  34.11 
 
 
357 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  34.54 
 
 
374 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  36.12 
 
 
365 aa  208  1e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3863  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.97 
 
 
359 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003668  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  32.59 
 
 
373 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.44 
 
 
370 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.21 
 
 
366 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  34.54 
 
 
374 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0350  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.3 
 
 
397 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1236  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.3 
 
 
397 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>