More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2500 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
433 aa  862    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  50.25 
 
 
419 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  45.61 
 
 
420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  40.85 
 
 
412 aa  250  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  40.41 
 
 
392 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  32.09 
 
 
363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  33.59 
 
 
449 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28.03 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  31.01 
 
 
862 aa  113  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  26.89 
 
 
448 aa  113  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  32.98 
 
 
309 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  27.91 
 
 
447 aa  107  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  30.67 
 
 
447 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  31.18 
 
 
440 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  32.5 
 
 
309 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  33.44 
 
 
311 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  29.21 
 
 
389 aa  100  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  32.3 
 
 
333 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  29.3 
 
 
576 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 
1191 aa  98.2  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  31.8 
 
 
320 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  32.83 
 
 
268 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.27 
 
 
14916 aa  94  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  29.95 
 
 
408 aa  94.4  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  32.33 
 
 
336 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  32.33 
 
 
336 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  28.14 
 
 
515 aa  93.2  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  31.49 
 
 
521 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.48 
 
 
493 aa  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  36.06 
 
 
489 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  29.31 
 
 
340 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  35.38 
 
 
567 aa  90.5  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  35.47 
 
 
351 aa  90.1  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  26.44 
 
 
450 aa  89.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  29.92 
 
 
872 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  29.64 
 
 
332 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  27.95 
 
 
401 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  31.6 
 
 
343 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  31.6 
 
 
343 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  28.83 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  36.71 
 
 
286 aa  87.4  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  38.41 
 
 
366 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  34.55 
 
 
844 aa  86.3  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  34.54 
 
 
219 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  27.95 
 
 
401 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  38.98 
 
 
225 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  34.33 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  37.24 
 
 
203 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 
493 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  28.35 
 
 
446 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  30.51 
 
 
776 aa  84.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  31.21 
 
 
319 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  32.28 
 
 
264 aa  84  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  30.35 
 
 
517 aa  84  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  34.82 
 
 
273 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  34.15 
 
 
903 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  32.93 
 
 
870 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  30.87 
 
 
295 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  29.9 
 
 
483 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  38.34 
 
 
216 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  35.18 
 
 
456 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  35.05 
 
 
231 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  27.39 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  33.2 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  27.25 
 
 
442 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  37.08 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  34.63 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  37.08 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  36.63 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  33.33 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  33.88 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  29.96 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  33.33 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  27.32 
 
 
401 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  27.32 
 
 
401 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  37.7 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  36.17 
 
 
1033 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  34.01 
 
 
199 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  31.86 
 
 
213 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  34.65 
 
 
452 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  27.97 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  21.78 
 
 
635 aa  78.2  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  34.76 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  32.39 
 
 
734 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  37.89 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  37.97 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  27.97 
 
 
262 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  36.13 
 
 
260 aa  77  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  25.14 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  35.94 
 
 
312 aa  77  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  28.54 
 
 
438 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  33.5 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  34.64 
 
 
846 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  30.09 
 
 
880 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  30.09 
 
 
880 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  30.09 
 
 
880 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  34.01 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  33.98 
 
 
485 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  30.38 
 
 
877 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  29.91 
 
 
420 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>