212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0026 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0026  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
178 aa  373  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3372  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 
203 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3896  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.36 
 
 
152 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01575  hypothetical protein  36.55 
 
 
153 aa  100  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3418  hypothetical protein  35.21 
 
 
177 aa  96.3  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0544122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3916  hypothetical protein  36.11 
 
 
165 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.919251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1395  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.86 
 
 
178 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.502759  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0754  rRNA methylase (SpoU_methylase)  35.21 
 
 
171 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1569  hypothetical protein  35.42 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.702393  hitchhiker  0.00445287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2233  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.8 
 
 
198 aa  92.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.237391  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1287  putative RNA methyltransferase  31.69 
 
 
152 aa  92  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000276682  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0567  putative rRNA methylase  38.24 
 
 
170 aa  91.7  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.96226  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07014  23S rRNA methyltransferase  37.01 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3116  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.03 
 
 
164 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2330  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.77 
 
 
162 aa  85.9  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18358  hitchhiker  0.00000314878 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01885  putative cold-shock RNA methyltransferase  30.56 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1420  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.53 
 
 
202 aa  85.1  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134713  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1485  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.53 
 
 
202 aa  85.1  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0129545  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1473  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.53 
 
 
202 aa  84.7  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.253583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4108  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.33 
 
 
156 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1304  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.33 
 
 
156 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1642  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.11 
 
 
177 aa  84.7  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00428557  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3075  RNA methyltransferase  33.81 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4585  RNA methyltransferase  32.64 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2447  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.43 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000932167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2765  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.43 
 
 
241 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000737812  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3013  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.03 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0108117  normal  0.339909 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2842  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30 
 
 
254 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.002241  decreased coverage  0.0000781436 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1611  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050624  normal  0.825884 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88222  predicted protein  30.14 
 
 
311 aa  78.6  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0289002 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2748  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.20465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2584  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.67 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2412  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.5 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0294882  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4113  RNA methyltransferase  28.29 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2719  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.53 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.159423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1568  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.03 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000175269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3894  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.5 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2663  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.14 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.299064  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.3 
 
 
200 aa  62  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.145291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1972  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.17 
 
 
197 aa  58.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0293079 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0088  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  30.06 
 
 
229 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4975  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.61 
 
 
235 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0953  RNA methyltransferase  29.79 
 
 
270 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  29.79 
 
 
270 aa  52.8  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.04 
 
 
326 aa  52.4  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  32.03 
 
 
277 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  30.56 
 
 
323 aa  51.6  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3859  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.67 
 
 
267 aa  51.2  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1443  RNA methyltransferase  29.33 
 
 
258 aa  51.2  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  29.71 
 
 
248 aa  51.2  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  29.71 
 
 
248 aa  51.2  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0606  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.5 
 
 
324 aa  51.2  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158472  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3360  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.94 
 
 
285 aa  50.8  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  31.37 
 
 
254 aa  50.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0856  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.87 
 
 
329 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1577  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  30.66 
 
 
229 aa  50.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0418  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.29 
 
 
223 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2051  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.33 
 
 
254 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154178  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0802  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.25 
 
 
229 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.681579  hitchhiker  0.00885649 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0351  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.56 
 
 
250 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04421  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.57 
 
 
223 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.961343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2969  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.27 
 
 
243 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4069  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.95 
 
 
229 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351215  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3951  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.95 
 
 
229 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339816  normal  0.0254174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4023  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.95 
 
 
229 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  28.97 
 
 
249 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.16 
 
 
315 aa  48.9  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3469  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein  23.08 
 
 
161 aa  48.5  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.029361 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.57 
 
 
223 aa  48.5  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0125765  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05145  putative SpoU rRNA methylase family protein  26.67 
 
 
178 aa  48.1  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1374  RNA methyltransferase  25.52 
 
 
274 aa  48.1  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02030  rRNA methylase  26.85 
 
 
234 aa  48.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3914  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.16 
 
 
250 aa  47.8  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0187406  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1097  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.62 
 
 
180 aa  47.8  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.734552  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.37 
 
 
254 aa  47.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.2 
 
 
246 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1304  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.61 
 
 
223 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2520  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.31 
 
 
173 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0517  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.81 
 
 
224 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0731  RNA methyltransferase  30.77 
 
 
328 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0083  RNA methyltransferase  29.25 
 
 
250 aa  47.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.1 
 
 
269 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335988  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2952  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.72 
 
 
327 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1213  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.29 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3986  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.95 
 
 
229 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03460  hypothetical protein  28.29 
 
 
229 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04211  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.77 
 
 
229 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0219  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.86 
 
 
274 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0038  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.83 
 
 
230 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4130  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.95 
 
 
229 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4154  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  26.49 
 
 
229 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0655  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.62 
 
 
319 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.229838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3862  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.29 
 
 
229 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5023  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.29 
 
 
229 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3960  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.95 
 
 
229 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4102  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.29 
 
 
229 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1559  RNA methyltransferase  30.15 
 
 
281 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12965  normal  0.228384 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0042  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.83 
 
 
230 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4179  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.83 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0060  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.29 
 
 
229 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>